Protein–RNA interactions for Protein: P50713

Defa15, Alpha-defensin 15, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa15P50713 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Defa15P50713 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Defa15P50713 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Defa15P50713 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Defa15P50713 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Defa15P50713 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Defa15P50713 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Defa15P50713 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,21■■□□□ 1,15
Defa15P50713 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Defa15P50713 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Defa15P50713 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
Defa15P50713 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Defa15P50713 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Defa15P50713 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,42■■□□□ 1,02
Defa15P50713 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,32■■□□□ 1
Defa15P50713 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Defa15P50713 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Defa15P50713 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Defa15P50713 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Defa15P50713 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Defa15P50713 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Defa15P50713 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Defa15P50713 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Defa15P50713 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Defa15P50713 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Defa15P50713 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Defa15P50713 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Defa15P50713 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,88■□□□□ 0,93
Defa15P50713 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Defa15P50713 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Defa15P50713 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Defa15P50713 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Defa15P50713 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Defa15P50713 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Defa15P50713 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Defa15P50713 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Defa15P50713 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Defa15P50713 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Defa15P50713 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Defa15P50713 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Defa15P50713 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Defa15P50713 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Defa15P50713 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,5■□□□□ 0,87
Defa15P50713 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Defa15P50713 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Defa15P50713 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Defa15P50713 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Defa15P50713 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Defa15P50713 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
Defa15P50713 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Defa15P50713 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Defa15P50713 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,3■□□□□ 0,84
Defa15P50713 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Defa15P50713 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Defa15P50713 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,15■□□□□ 0,82
Defa15P50713 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Defa15P50713 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Defa15P50713 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,08■□□□□ 0,8
Defa15P50713 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,06■□□□□ 0,8
Defa15P50713 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Defa15P50713 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
Defa15P50713 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Defa15P50713 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
Defa15P50713 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Defa15P50713 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Defa15P50713 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Defa15P50713 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Defa15P50713 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Defa15P50713 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,84■□□□□ 0,77
Defa15P50713 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,83■□□□□ 0,77
Defa15P50713 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Defa15P50713 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Defa15P50713 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Defa15P50713 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Defa15P50713 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Defa15P50713 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,73■□□□□ 0,75
Defa15P50713 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Defa15P50713 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Defa15P50713 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,67■□□□□ 0,74
Defa15P50713 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Defa15P50713 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,64■□□□□ 0,74
Defa15P50713 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Defa15P50713 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,62■□□□□ 0,73
Defa15P50713 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,61■□□□□ 0,73
Defa15P50713 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Defa15P50713 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,57■□□□□ 0,72
Defa15P50713 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,55■□□□□ 0,72
Defa15P50713 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Defa15P50713 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Defa15P50713 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Defa15P50713 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Defa15P50713 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Defa15P50713 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19,48■□□□□ 0,71
Defa15P50713 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Defa15P50713 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,45■□□□□ 0,7
Defa15P50713 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Defa15P50713 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Defa15P50713 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Defa15P50713 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Defa15P50713 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,5 ms