RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrps12O35680 139 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10509O88255 85 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Polr2kQ63871 58 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AI854703Q8BIN3 203 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BB014433Q8C5R5 389 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BC106179Q8C9L1 186 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Defb11Q8R2I7 77 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndufc2Q9CQ54 120 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tctex1d2Q9CQ66 144 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ifitm1Q9D103 106 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PmvkQ9D1G2 192 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lyzl4Q9D925 145 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wfdc2Q9DAU7 174 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sorl1O88307 2215 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Brwd1Q921C3 2304 aa6.77□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PtprqP0C5E4 2300 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nat8f4G5E8L3 226 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01738 130 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q3UNZ8 350 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ntn5Q3UQ22 452 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eif4ebp1Q60876 117 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 H1fxQ80ZM5 188 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Defb42Q8BVB5 75 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chchd7Q8K2Q5 85 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TroQ6DIC6 2087 aa6.76□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GfyJ3KML8 504 aa6.75□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Aqp7O54794 303 aa6.75□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcl1b4P56844 120 aa6.75□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa6.75□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa6.75□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10490F6VBM2 120 aa6.74□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krtap24-1G3X9A2 248 aa6.74□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 C1qcQ02105 246 aa6.74□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd164l2Q9D6W7 172 aa6.74□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ociad2Q9D8W7 154 aa6.74□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tex48Q9DA81 110 aa6.74□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dkk2Q9QYZ8 259 aa6.74□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv8-4A0A0A6YW26 117 aa6.73□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm28305F6U473 122 aa6.73□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TtrP07309 147 aa6.73□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P0C913 63 aa6.73□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ly6c2P0CW03 131 aa6.73□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pmis2Q497Q9 96 aa6.73□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MturnQ8CGA4 131 aa6.73□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cysltr1Q99JA4 352 aa6.73□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem263Q9DAM7 115 aa6.73□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pkd1l1Q8R526 2615 aa6.72□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm19668J3QMD1 248 aa6.72□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Emp2O88662 172 aa6.72□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klk9Q32M27 251 aa6.72□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm815Q3UWS2 115 aa6.72□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cox7a2lQ61387 111 aa6.72□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ss18Q62280 418 aa6.72□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm16223Q8CBM3 117 aa6.72□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ssbp1Q9CYR0 152 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Timm17aQ9Z0V8 171 aa6.72□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tenm2Q9WTS5 2764 aa6.71□□□□□ -1.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm9376G3UW68 176 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcrg-C3L7N479 172 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Egr2P08152 470 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Igll1P20764 209 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gata3P23772 443 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fxyd7P59648 80 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm1968Q3T9I3 115 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trappc1Q5NCF2 145 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trav7-2Q5R1I3 112 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Htr1dQ61224 374 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa6.71□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm17472A0A075B683 117 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm17359A0A0G2JEB7 487 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sec61gP60060 68 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mllt11P97783 90 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BC025920Q3US60 128 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Snx22Q8C084 192 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ammecr1lQ8JZZ6 310 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp5lQ9CPQ8 103 aa6.7□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv1-5A0A0A6YWG2 117 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv8-8A0A0A6YXQ0 119 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Defa34D3Z0J0 93 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Defa37K9J724 93 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CrxO54751 299 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Defa5P28312 93 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Foxi1Q922I5 372 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tspo2Q9CRZ8 162 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lypd5Q9D7Z7 256 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q9D8Q6 235 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SelenokQ9JLJ1 94 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ApcQ61315 2845 aa6.69□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Esp4A8R0T8 117 aa6.68□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 B230217C12RikE9Q3Z1 139 aa6.68□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P03985 172 aa6.68□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem101Q91VP7 257 aa6.68□□□□□ -1.34
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 8030423J24RikQ9CX45 142 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.4 ms