RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.65■□□□□ 0.9
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chic1Q8CBW7 227 aa20.64■□□□□ 0.89
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa19.71■□□□□ 0.75
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NischQ80TM9 1593 aa19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abcc9P70170 1546 aa18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abcc8B2RUS7 1588 aa18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Phf23Q8BSN5 401 aa18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ScribQ80U72 1612 aa18.38■□□□□ 0.53
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kdm5dQ62240 1548 aa17.62■□□□□ 0.41
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NacadQ5SWP3 1504 aa17.6■□□□□ 0.41
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gab3Q8BSM5 595 aa17.57■□□□□ 0.4
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plppr3Q7TPB0 716 aa17.46■□□□□ 0.39
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa17.36■□□□□ 0.37
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sycp2Q9CUU3 1500 aa17.31■□□□□ 0.36
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BicraF8VPZ9 1578 aa17.23■□□□□ 0.35
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dcaf1Q80TR8 1506 aa17.13■□□□□ 0.33
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rhox8Q6VSS7 320 aa16.88■□□□□ 0.29
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rtl1Q7M732 1744 aa16.66■□□□□ 0.26
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc180J3QNE4 1664 aa16.5■□□□□ 0.23
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa16.49■□□□□ 0.23
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Baz1aO88379 1555 aa16.47■□□□□ 0.23
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Crybg2B7ZCC2 1516 aa16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ercc6F8VPZ5 1481 aa16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smarca2Q6DIC0 1577 aa16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam135aQ6NS59 1506 aa16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Frmpd1A2AKB4 1549 aa16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr62Q3U3T8 1523 aa16.11■□□□□ 0.17
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Unc13aQ4KUS2 1712 aa16.01■□□□□ 0.15
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnajc5P60904 198 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ubl4bQ9CQ84 188 aa15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Baz1bQ9Z277 1479 aa15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrc2Q64449 1479 aa15.85■□□□□ 0.13
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim41Q5NCC3 630 aa15.8■□□□□ 0.12
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa15.64■□□□□ 0.09
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa15.63■□□□□ 0.09
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CftrP26361 1476 aa15.63■□□□□ 0.09
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Synj1Q8CHC4 1574 aa15.62■□□□□ 0.09
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa15.61■□□□□ 0.09
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HrcG5E8J6 738 aa15.6■□□□□ 0.09
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcna4Q61423 654 aa15.57■□□□□ 0.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam163aQ8CAA5 168 aa15.53■□□□□ 0.08
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kif21aQ9QXL2 1672 aa15.5■□□□□ 0.07
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cux2P70298 1426 aa15.44■□□□□ 0.06
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kif15Q6P9L6 1387 aa15.35■□□□□ 0.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Shroom2A2ALU4 1481 aa15.33■□□□□ 0.04
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lamc3Q9R0B6 1581 aa15.25■□□□□ 0.03
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col17a1Q07563 1470 aa15.24■□□□□ 0.03
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Golga3P55937 1487 aa15.2■□□□□ 0.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plb1Q3TTY0 1478 aa15.14■□□□□ 0.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cep164Q5DU05 1446 aa15.13■□□□□ 0.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Top2bQ64511 1612 aa15.1■□□□□ 0.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Crocc2F6XLV1 1638 aa15.03■□□□□ -0
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cngb1E1AZ71 1325 aa15.02■□□□□ -0
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TnnQ80Z71 1560 aa15□□□□□ -0.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Il27Q8K3I6 234 aa15□□□□□ -0.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rusc2Q80U22 1514 aa14.99□□□□□ -0.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Camsap1A2AHC3 1581 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxd11P23813 323 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Setd1bQ8CFT2 1985 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc18Q640L5 1455 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fmn1Q05860 1466 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ift140E9PY46 1464 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Disp1Q3TDN0 1521 aa14.82□□□□□ -0.04
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trap1aP19473 224 aa14.81□□□□□ -0.04
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Duox2A2AQ99 1517 aa14.81□□□□□ -0.04
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa14.76□□□□□ -0.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Samd9lQ69Z37 1561 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adgrl3Q80TS3 1537 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa14.7□□□□□ -0.06
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cep170Q6A065 1588 aa14.7□□□□□ -0.06
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grin2bQ01097 1482 aa14.69□□□□□ -0.06
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PtprkP35822 1457 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 67 ms