Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX45

8030423J24Rik, MCG54345, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030423J24RikQ9CX45 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,29■■□□□ 1,8
8030423J24RikQ9CX45 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
8030423J24RikQ9CX45 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
8030423J24RikQ9CX45 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
8030423J24RikQ9CX45 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
8030423J24RikQ9CX45 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
8030423J24RikQ9CX45 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
8030423J24RikQ9CX45 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,37■■□□□ 1,33
8030423J24RikQ9CX45 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
8030423J24RikQ9CX45 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
8030423J24RikQ9CX45 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
8030423J24RikQ9CX45 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,95■■□□□ 1,26
8030423J24RikQ9CX45 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
8030423J24RikQ9CX45 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
8030423J24RikQ9CX45 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,61■■□□□ 1,21
8030423J24RikQ9CX45 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
8030423J24RikQ9CX45 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
8030423J24RikQ9CX45 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
8030423J24RikQ9CX45 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
8030423J24RikQ9CX45 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
8030423J24RikQ9CX45 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
8030423J24RikQ9CX45 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
8030423J24RikQ9CX45 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
8030423J24RikQ9CX45 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
8030423J24RikQ9CX45 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
8030423J24RikQ9CX45 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
8030423J24RikQ9CX45 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,99■■□□□ 1,11
8030423J24RikQ9CX45 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,98■■□□□ 1,11
8030423J24RikQ9CX45 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
8030423J24RikQ9CX45 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
8030423J24RikQ9CX45 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
8030423J24RikQ9CX45 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
8030423J24RikQ9CX45 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
8030423J24RikQ9CX45 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
8030423J24RikQ9CX45 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,77■■□□□ 1,08
8030423J24RikQ9CX45 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
8030423J24RikQ9CX45 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
8030423J24RikQ9CX45 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
8030423J24RikQ9CX45 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,61■■□□□ 1,05
8030423J24RikQ9CX45 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
8030423J24RikQ9CX45 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
8030423J24RikQ9CX45 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,48■■□□□ 1,03
8030423J24RikQ9CX45 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,46■■□□□ 1,03
8030423J24RikQ9CX45 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
8030423J24RikQ9CX45 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
8030423J24RikQ9CX45 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
8030423J24RikQ9CX45 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
8030423J24RikQ9CX45 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,22■□□□□ 0,99
8030423J24RikQ9CX45 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
8030423J24RikQ9CX45 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
8030423J24RikQ9CX45 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
8030423J24RikQ9CX45 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
8030423J24RikQ9CX45 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
8030423J24RikQ9CX45 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
8030423J24RikQ9CX45 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
8030423J24RikQ9CX45 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
8030423J24RikQ9CX45 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,91■□□□□ 0,94
8030423J24RikQ9CX45 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,94
8030423J24RikQ9CX45 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
8030423J24RikQ9CX45 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
8030423J24RikQ9CX45 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
8030423J24RikQ9CX45 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
8030423J24RikQ9CX45 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
8030423J24RikQ9CX45 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,79■□□□□ 0,92
8030423J24RikQ9CX45 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
8030423J24RikQ9CX45 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
8030423J24RikQ9CX45 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
8030423J24RikQ9CX45 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
8030423J24RikQ9CX45 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
8030423J24RikQ9CX45 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
8030423J24RikQ9CX45 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
8030423J24RikQ9CX45 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
8030423J24RikQ9CX45 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,66■□□□□ 0,9
8030423J24RikQ9CX45 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
8030423J24RikQ9CX45 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
8030423J24RikQ9CX45 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20,63■□□□□ 0,89
8030423J24RikQ9CX45 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
8030423J24RikQ9CX45 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
8030423J24RikQ9CX45 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,56■□□□□ 0,88
8030423J24RikQ9CX45 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,55■□□□□ 0,88
8030423J24RikQ9CX45 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
8030423J24RikQ9CX45 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20,49■□□□□ 0,87
8030423J24RikQ9CX45 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
8030423J24RikQ9CX45 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
8030423J24RikQ9CX45 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
8030423J24RikQ9CX45 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
8030423J24RikQ9CX45 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
8030423J24RikQ9CX45 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
8030423J24RikQ9CX45 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
8030423J24RikQ9CX45 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
8030423J24RikQ9CX45 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20,37■□□□□ 0,85
8030423J24RikQ9CX45 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
8030423J24RikQ9CX45 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
8030423J24RikQ9CX45 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
8030423J24RikQ9CX45 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
8030423J24RikQ9CX45 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,24■□□□□ 0,83
8030423J24RikQ9CX45 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
8030423J24RikQ9CX45 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
8030423J24RikQ9CX45 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,18■□□□□ 0,82
8030423J24RikQ9CX45 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms