RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041638.7

Gtf3c3-201, Transcript of General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c3, Length 4,582 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm5741B2RVA4 72 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 1500009C09RikD3YYW9 81 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm9767G3X930 207 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Phxr5P08399 672 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Defa1P11477 93 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Duxbl2Q7TNE6 350 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Nkg7Q99PA5 165 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Hyls1Q9CXX0 307 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tmprss5Q9ER04 455 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Herc2Q4U2R1 4836 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trav6n-5A0A075B621 112 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trav4-2A0A075B638 110 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trav6-5A0A075B6B5 112 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv9-4A0A0A6YWH6 117 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv6-4A0A0A6YX19 119 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm20825J3QM67 227 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 TcraP01849 138 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tmem213Q08EA8 116 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ssty2Q149W4 227 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm21394Q497R7 227 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm20854Q62461 227 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gpr132Q9Z282 382 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 PdfS4R2K0 231 aa3.28□□□□□ -1.88
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tcrg-C3L7N479 172 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 P03985 172 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Znf239P24399 201 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ccl6P27784 116 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Psg27Q497W2 474 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Cd33Q63994 403 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Rpp25lQ99JH1 163 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Rnf114Q9ET26 229 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Fat3Q8BNA6 4555 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv6-3A0A075B5T2 118 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm7075D3Z497 112 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Glrx2Q923X4 156 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 RetnQ99P87 114 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4930544G11RikQ9CR99 193 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tspan13Q9D8C2 204 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv1-4A0A075B5T4 117 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Igkv1-133A0A0B4J1H8 120 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 PkigO70139 76 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Smrp1Q2MH31 260 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 A630076J17RikJ3QQ32 107 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm6871L7N248 545 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 P01741 114 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm94Q3V2D2 93 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Q5BN45 167 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Znf474Q6V5K9 347 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Pla2g2eQ9QUL3 142 aa3.27□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 FasnP19096 2504 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trav21-dv12A0A075B6C4 109 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tm4sf19E9Q9H8 206 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm8439G3UWA7 96 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Rnase1P00683 149 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Rpl23P62830 140 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm10447Q3UQ92 135 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ang2Q64438 145 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Dusp14Q9JLY7 198 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm28845A0A087WR76 214 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ighv8-2A0A0A6YW58 119 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Cox11Q6P8I6 275 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Tmem91Q8C581 172 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Vmn1r216Q8R257 298 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Sh3bgrl3Q91VW3 93 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Atp5lQ9CPQ8 103 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Esm1Q9QYY7 184 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm10203F6QJ09 66 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Efnb3O35393 340 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ly6g5bQ8K1T4 194 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 UrahQ9CRB3 118 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Cbln1Q9R171 193 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trav9d-1A0A075B699 112 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Olfr1016A2ASV2 309 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Vmn1r1E9PVR6 306 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ccl17F6R5P4 103 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Cmc4Q61908 68 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 OstcQ78XF5 149 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Pygo2Q80V76 405 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Olfr498Q8VEW2 330 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Cldn16Q925N4 235 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Necap2Q9D1J1 266 aa3.26□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Bsph1Q3UW26 133 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Olfr317Q5NCD6 327 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gphb5Q812B2 130 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Ube2e2Q91W82 201 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Obox1Q9D350 204 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Mrps11Q9DCA2 191 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 PerpQ9JK95 193 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 SelenokQ9JLJ1 94 aa3.25□□□□□ -1.89
Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 Gm28269A0A087WSG3 125 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.5 ms