Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YW58

Ighv8-2, Immunoglobulin heavy variable V8-2 (Fragment), mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv8-2A0A0A6YW58 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ighv8-2A0A0A6YW58 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ighv8-2A0A0A6YW58 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ighv8-2A0A0A6YW58 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ighv8-2A0A0A6YW58 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ighv8-2A0A0A6YW58 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ighv8-2A0A0A6YW58 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ighv8-2A0A0A6YW58 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ighv8-2A0A0A6YW58 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ighv8-2A0A0A6YW58 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ighv8-2A0A0A6YW58 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighv8-2A0A0A6YW58 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighv8-2A0A0A6YW58 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ighv8-2A0A0A6YW58 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ighv8-2A0A0A6YW58 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ighv8-2A0A0A6YW58 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ighv8-2A0A0A6YW58 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ighv8-2A0A0A6YW58 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighv8-2A0A0A6YW58 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighv8-2A0A0A6YW58 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighv8-2A0A0A6YW58 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ighv8-2A0A0A6YW58 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighv8-2A0A0A6YW58 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighv8-2A0A0A6YW58 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighv8-2A0A0A6YW58 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighv8-2A0A0A6YW58 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighv8-2A0A0A6YW58 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighv8-2A0A0A6YW58 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv8-2A0A0A6YW58 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighv8-2A0A0A6YW58 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ighv8-2A0A0A6YW58 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ighv8-2A0A0A6YW58 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ighv8-2A0A0A6YW58 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighv8-2A0A0A6YW58 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv8-2A0A0A6YW58 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighv8-2A0A0A6YW58 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighv8-2A0A0A6YW58 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighv8-2A0A0A6YW58 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ighv8-2A0A0A6YW58 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv8-2A0A0A6YW58 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv8-2A0A0A6YW58 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighv8-2A0A0A6YW58 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv8-2A0A0A6YW58 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighv8-2A0A0A6YW58 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighv8-2A0A0A6YW58 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighv8-2A0A0A6YW58 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighv8-2A0A0A6YW58 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighv8-2A0A0A6YW58 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighv8-2A0A0A6YW58 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv8-2A0A0A6YW58 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ighv8-2A0A0A6YW58 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighv8-2A0A0A6YW58 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv8-2A0A0A6YW58 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv8-2A0A0A6YW58 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv8-2A0A0A6YW58 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ighv8-2A0A0A6YW58 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ighv8-2A0A0A6YW58 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv8-2A0A0A6YW58 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv8-2A0A0A6YW58 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ighv8-2A0A0A6YW58 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv8-2A0A0A6YW58 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv8-2A0A0A6YW58 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv8-2A0A0A6YW58 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighv8-2A0A0A6YW58 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighv8-2A0A0A6YW58 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv8-2A0A0A6YW58 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ighv8-2A0A0A6YW58 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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