Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YW58

Ighv8-2, Immunoglobulin heavy variable V8-2 (Fragment), mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv8-2A0A0A6YW58 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ighv8-2A0A0A6YW58 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ighv8-2A0A0A6YW58 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ighv8-2A0A0A6YW58 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ighv8-2A0A0A6YW58 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
Ighv8-2A0A0A6YW58 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ighv8-2A0A0A6YW58 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Ighv8-2A0A0A6YW58 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ighv8-2A0A0A6YW58 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Ighv8-2A0A0A6YW58 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Ighv8-2A0A0A6YW58 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Ighv8-2A0A0A6YW58 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
Ighv8-2A0A0A6YW58 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Ighv8-2A0A0A6YW58 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
Ighv8-2A0A0A6YW58 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Ighv8-2A0A0A6YW58 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ighv8-2A0A0A6YW58 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,43■■□□□ 1,34
Ighv8-2A0A0A6YW58 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ighv8-2A0A0A6YW58 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,4■■□□□ 1,34
Ighv8-2A0A0A6YW58 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ighv8-2A0A0A6YW58 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ighv8-2A0A0A6YW58 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ighv8-2A0A0A6YW58 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ighv8-2A0A0A6YW58 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ighv8-2A0A0A6YW58 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ighv8-2A0A0A6YW58 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ighv8-2A0A0A6YW58 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,83■■□□□ 1,25
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ighv8-2A0A0A6YW58 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ighv8-2A0A0A6YW58 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ighv8-2A0A0A6YW58 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Ighv8-2A0A0A6YW58 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,64■■□□□ 1,22
Ighv8-2A0A0A6YW58 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Ighv8-2A0A0A6YW58 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Ighv8-2A0A0A6YW58 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,56■■□□□ 1,2
Ighv8-2A0A0A6YW58 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Ighv8-2A0A0A6YW58 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,38■■□□□ 1,17
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Ighv8-2A0A0A6YW58 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Ighv8-2A0A0A6YW58 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Ighv8-2A0A0A6YW58 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ighv8-2A0A0A6YW58 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Ighv8-2A0A0A6YW58 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Ighv8-2A0A0A6YW58 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Ighv8-2A0A0A6YW58 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Ighv8-2A0A0A6YW58 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
Ighv8-2A0A0A6YW58 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Ighv8-2A0A0A6YW58 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,08■■□□□ 1,13
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Ighv8-2A0A0A6YW58 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Ighv8-2A0A0A6YW58 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Ighv8-2A0A0A6YW58 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Ighv8-2A0A0A6YW58 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ighv8-2A0A0A6YW58 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ighv8-2A0A0A6YW58 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Ighv8-2A0A0A6YW58 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Ighv8-2A0A0A6YW58 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ighv8-2A0A0A6YW58 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Ighv8-2A0A0A6YW58 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Ighv8-2A0A0A6YW58 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ighv8-2A0A0A6YW58 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Ighv8-2A0A0A6YW58 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Ighv8-2A0A0A6YW58 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ighv8-2A0A0A6YW58 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Ighv8-2A0A0A6YW58 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Ighv8-2A0A0A6YW58 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ighv8-2A0A0A6YW58 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ighv8-2A0A0A6YW58 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,41■■□□□ 1,02
Ighv8-2A0A0A6YW58 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Ighv8-2A0A0A6YW58 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Ighv8-2A0A0A6YW58 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Ighv8-2A0A0A6YW58 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Ighv8-2A0A0A6YW58 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
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