Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX19

Ighv6-4, Immunoglobulin heavy variable V6-4 (Fragment), mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv6-4A0A0A6YX19 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ighv6-4A0A0A6YX19 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Ighv6-4A0A0A6YX19 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ighv6-4A0A0A6YX19 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ighv6-4A0A0A6YX19 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ighv6-4A0A0A6YX19 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Ighv6-4A0A0A6YX19 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ighv6-4A0A0A6YX19 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ighv6-4A0A0A6YX19 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ighv6-4A0A0A6YX19 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ighv6-4A0A0A6YX19 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ighv6-4A0A0A6YX19 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Ighv6-4A0A0A6YX19 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Ighv6-4A0A0A6YX19 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Ighv6-4A0A0A6YX19 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ighv6-4A0A0A6YX19 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ighv6-4A0A0A6YX19 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Ighv6-4A0A0A6YX19 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ighv6-4A0A0A6YX19 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Ighv6-4A0A0A6YX19 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Ighv6-4A0A0A6YX19 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ighv6-4A0A0A6YX19 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,53■■□□□ 1,36
Ighv6-4A0A0A6YX19 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ighv6-4A0A0A6YX19 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Ighv6-4A0A0A6YX19 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ighv6-4A0A0A6YX19 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ighv6-4A0A0A6YX19 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ighv6-4A0A0A6YX19 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ighv6-4A0A0A6YX19 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ighv6-4A0A0A6YX19 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ighv6-4A0A0A6YX19 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ighv6-4A0A0A6YX19 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,95■■□□□ 1,26
Ighv6-4A0A0A6YX19 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ighv6-4A0A0A6YX19 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
Ighv6-4A0A0A6YX19 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ighv6-4A0A0A6YX19 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ighv6-4A0A0A6YX19 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Ighv6-4A0A0A6YX19 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Ighv6-4A0A0A6YX19 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,62■■□□□ 1,21
Ighv6-4A0A0A6YX19 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Ighv6-4A0A0A6YX19 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Ighv6-4A0A0A6YX19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ighv6-4A0A0A6YX19 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ighv6-4A0A0A6YX19 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ighv6-4A0A0A6YX19 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Ighv6-4A0A0A6YX19 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ighv6-4A0A0A6YX19 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Ighv6-4A0A0A6YX19 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Ighv6-4A0A0A6YX19 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
Ighv6-4A0A0A6YX19 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Ighv6-4A0A0A6YX19 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ighv6-4A0A0A6YX19 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ighv6-4A0A0A6YX19 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ighv6-4A0A0A6YX19 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Ighv6-4A0A0A6YX19 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Ighv6-4A0A0A6YX19 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Ighv6-4A0A0A6YX19 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Ighv6-4A0A0A6YX19 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Ighv6-4A0A0A6YX19 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Ighv6-4A0A0A6YX19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Ighv6-4A0A0A6YX19 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Ighv6-4A0A0A6YX19 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,02■■□□□ 1,12
Ighv6-4A0A0A6YX19 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Ighv6-4A0A0A6YX19 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ighv6-4A0A0A6YX19 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ighv6-4A0A0A6YX19 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ighv6-4A0A0A6YX19 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ighv6-4A0A0A6YX19 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Ighv6-4A0A0A6YX19 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ighv6-4A0A0A6YX19 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Ighv6-4A0A0A6YX19 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Ighv6-4A0A0A6YX19 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Ighv6-4A0A0A6YX19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
Ighv6-4A0A0A6YX19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,71■■□□□ 1,07
Ighv6-4A0A0A6YX19 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Ighv6-4A0A0A6YX19 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
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