Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B699

Trav9d-1, T cell receptor alpha variable 9D-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav9d-1A0A075B699 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Trav9d-1A0A075B699 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Trav9d-1A0A075B699 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Trav9d-1A0A075B699 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trav9d-1A0A075B699 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Trav9d-1A0A075B699 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
Trav9d-1A0A075B699 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Trav9d-1A0A075B699 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Trav9d-1A0A075B699 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,31■■□□□ 1,48
Trav9d-1A0A075B699 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Trav9d-1A0A075B699 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Trav9d-1A0A075B699 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Trav9d-1A0A075B699 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Trav9d-1A0A075B699 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Trav9d-1A0A075B699 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,79■■□□□ 1,4
Trav9d-1A0A075B699 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Trav9d-1A0A075B699 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Trav9d-1A0A075B699 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Trav9d-1A0A075B699 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Trav9d-1A0A075B699 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Trav9d-1A0A075B699 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,34■■□□□ 1,33
Trav9d-1A0A075B699 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Trav9d-1A0A075B699 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Trav9d-1A0A075B699 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Trav9d-1A0A075B699 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Trav9d-1A0A075B699 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Trav9d-1A0A075B699 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Trav9d-1A0A075B699 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Trav9d-1A0A075B699 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,05■■□□□ 1,28
Trav9d-1A0A075B699 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Trav9d-1A0A075B699 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Trav9d-1A0A075B699 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,89■■□□□ 1,26
Trav9d-1A0A075B699 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Trav9d-1A0A075B699 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Trav9d-1A0A075B699 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Trav9d-1A0A075B699 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,79■■□□□ 1,24
Trav9d-1A0A075B699 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Trav9d-1A0A075B699 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Trav9d-1A0A075B699 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Trav9d-1A0A075B699 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Trav9d-1A0A075B699 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Trav9d-1A0A075B699 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,58■■□□□ 1,21
Trav9d-1A0A075B699 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Trav9d-1A0A075B699 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Trav9d-1A0A075B699 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,43■■□□□ 1,18
Trav9d-1A0A075B699 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Trav9d-1A0A075B699 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Trav9d-1A0A075B699 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
Trav9d-1A0A075B699 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Trav9d-1A0A075B699 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Trav9d-1A0A075B699 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Trav9d-1A0A075B699 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Trav9d-1A0A075B699 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Trav9d-1A0A075B699 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Trav9d-1A0A075B699 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Trav9d-1A0A075B699 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trav9d-1A0A075B699 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,92■■□□□ 1,1
Trav9d-1A0A075B699 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Trav9d-1A0A075B699 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Trav9d-1A0A075B699 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Trav9d-1A0A075B699 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Trav9d-1A0A075B699 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Trav9d-1A0A075B699 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Trav9d-1A0A075B699 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,8■■□□□ 1,08
Trav9d-1A0A075B699 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Trav9d-1A0A075B699 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Trav9d-1A0A075B699 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Trav9d-1A0A075B699 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Trav9d-1A0A075B699 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Trav9d-1A0A075B699 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Trav9d-1A0A075B699 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,06
Trav9d-1A0A075B699 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Trav9d-1A0A075B699 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Trav9d-1A0A075B699 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Trav9d-1A0A075B699 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Trav9d-1A0A075B699 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Trav9d-1A0A075B699 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Trav9d-1A0A075B699 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Trav9d-1A0A075B699 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Trav9d-1A0A075B699 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Trav9d-1A0A075B699 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,39■■□□□ 1,01
Trav9d-1A0A075B699 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Trav9d-1A0A075B699 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Trav9d-1A0A075B699 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Trav9d-1A0A075B699 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Trav9d-1A0A075B699 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,31■■□□□ 1
Trav9d-1A0A075B699 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Trav9d-1A0A075B699 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Trav9d-1A0A075B699 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Trav9d-1A0A075B699 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Trav9d-1A0A075B699 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Trav9d-1A0A075B699 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Trav9d-1A0A075B699 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Trav9d-1A0A075B699 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Trav9d-1A0A075B699 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Trav9d-1A0A075B699 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Trav9d-1A0A075B699 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Trav9d-1A0A075B699 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Trav9d-1A0A075B699 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Trav9d-1A0A075B699 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms