Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Efnb3O35393 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Efnb3O35393 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Efnb3O35393 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Efnb3O35393 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Efnb3O35393 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Efnb3O35393 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efnb3O35393 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Efnb3O35393 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efnb3O35393 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efnb3O35393 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Efnb3O35393 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efnb3O35393 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efnb3O35393 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efnb3O35393 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efnb3O35393 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Efnb3O35393 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Efnb3O35393 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efnb3O35393 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Efnb3O35393 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efnb3O35393 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Efnb3O35393 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efnb3O35393 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efnb3O35393 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efnb3O35393 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Efnb3O35393 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efnb3O35393 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efnb3O35393 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efnb3O35393 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Efnb3O35393 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efnb3O35393 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Efnb3O35393 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efnb3O35393 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efnb3O35393 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efnb3O35393 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efnb3O35393 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efnb3O35393 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efnb3O35393 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Efnb3O35393 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efnb3O35393 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efnb3O35393 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efnb3O35393 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efnb3O35393 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efnb3O35393 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efnb3O35393 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efnb3O35393 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Efnb3O35393 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efnb3O35393 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efnb3O35393 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efnb3O35393 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efnb3O35393 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efnb3O35393 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Efnb3O35393 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efnb3O35393 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efnb3O35393 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efnb3O35393 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efnb3O35393 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efnb3O35393 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efnb3O35393 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efnb3O35393 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efnb3O35393 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efnb3O35393 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efnb3O35393 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Efnb3O35393 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efnb3O35393 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efnb3O35393 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efnb3O35393 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efnb3O35393 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efnb3O35393 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efnb3O35393 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efnb3O35393 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efnb3O35393 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Efnb3O35393 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efnb3O35393 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Efnb3O35393 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efnb3O35393 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efnb3O35393 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efnb3O35393 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efnb3O35393 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efnb3O35393 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efnb3O35393 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efnb3O35393 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efnb3O35393 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efnb3O35393 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efnb3O35393 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efnb3O35393 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efnb3O35393 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efnb3O35393 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efnb3O35393 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efnb3O35393 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efnb3O35393 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efnb3O35393 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efnb3O35393 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efnb3O35393 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efnb3O35393 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efnb3O35393 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efnb3O35393 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efnb3O35393 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efnb3O35393 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efnb3O35393 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms