Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan13Q9D8C2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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Tspan13Q9D8C2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Tspan13Q9D8C2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan13Q9D8C2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan13Q9D8C2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan13Q9D8C2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan13Q9D8C2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan13Q9D8C2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan13Q9D8C2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan13Q9D8C2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan13Q9D8C2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan13Q9D8C2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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