Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Tspan13Q9D8C2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Tspan13Q9D8C2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Tspan13Q9D8C2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Tspan13Q9D8C2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Tspan13Q9D8C2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,68■■□□□ 1,22
Tspan13Q9D8C2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,66■■□□□ 1,22
Tspan13Q9D8C2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Tspan13Q9D8C2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Tspan13Q9D8C2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,35■■□□□ 1,17
Tspan13Q9D8C2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Tspan13Q9D8C2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,14■■□□□ 1,13
Tspan13Q9D8C2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Tspan13Q9D8C2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Tspan13Q9D8C2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Tspan13Q9D8C2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,76■■□□□ 1,07
Tspan13Q9D8C2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Tspan13Q9D8C2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Tspan13Q9D8C2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Tspan13Q9D8C2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Tspan13Q9D8C2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Tspan13Q9D8C2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,21■□□□□ 0,99
Tspan13Q9D8C2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Tspan13Q9D8C2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Tspan13Q9D8C2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Tspan13Q9D8C2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Tspan13Q9D8C2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Tspan13Q9D8C2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Tspan13Q9D8C2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Tspan13Q9D8C2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Tspan13Q9D8C2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Tspan13Q9D8C2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Tspan13Q9D8C2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Tspan13Q9D8C2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Tspan13Q9D8C2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Tspan13Q9D8C2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Tspan13Q9D8C2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Tspan13Q9D8C2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Tspan13Q9D8C2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Tspan13Q9D8C2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,81■□□□□ 0,92
Tspan13Q9D8C2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Tspan13Q9D8C2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Tspan13Q9D8C2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Tspan13Q9D8C2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Tspan13Q9D8C2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Tspan13Q9D8C2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Tspan13Q9D8C2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20,62■□□□□ 0,89
Tspan13Q9D8C2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Tspan13Q9D8C2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Tspan13Q9D8C2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Tspan13Q9D8C2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Tspan13Q9D8C2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Tspan13Q9D8C2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Tspan13Q9D8C2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Tspan13Q9D8C2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Tspan13Q9D8C2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
Tspan13Q9D8C2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,32■□□□□ 0,84
Tspan13Q9D8C2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Tspan13Q9D8C2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Tspan13Q9D8C2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Tspan13Q9D8C2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Tspan13Q9D8C2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Tspan13Q9D8C2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Tspan13Q9D8C2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,12■□□□□ 0,81
Tspan13Q9D8C2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Tspan13Q9D8C2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Tspan13Q9D8C2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Tspan13Q9D8C2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,08■□□□□ 0,81
Tspan13Q9D8C2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Tspan13Q9D8C2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Tspan13Q9D8C2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Tspan13Q9D8C2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Tspan13Q9D8C2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Tspan13Q9D8C2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Tspan13Q9D8C2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Tspan13Q9D8C2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Tspan13Q9D8C2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Tspan13Q9D8C2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Tspan13Q9D8C2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Tspan13Q9D8C2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Tspan13Q9D8C2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19,84■□□□□ 0,77
Tspan13Q9D8C2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19,82■□□□□ 0,76
Tspan13Q9D8C2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Tspan13Q9D8C2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19,8■□□□□ 0,76
Tspan13Q9D8C2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Tspan13Q9D8C2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19,71■□□□□ 0,75
Tspan13Q9D8C2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,7■□□□□ 0,74
Tspan13Q9D8C2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,69■□□□□ 0,74
Tspan13Q9D8C2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Tspan13Q9D8C2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,62■□□□□ 0,73
Tspan13Q9D8C2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
Tspan13Q9D8C2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Tspan13Q9D8C2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Tspan13Q9D8C2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Tspan13Q9D8C2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Tspan13Q9D8C2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19,56■□□□□ 0,72
Tspan13Q9D8C2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,55■□□□□ 0,72
Tspan13Q9D8C2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Tspan13Q9D8C2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19,54■□□□□ 0,72
Tspan13Q9D8C2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19,52■□□□□ 0,72
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