Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sh3bgrl3Q91VW3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bgrl3Q91VW3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bgrl3Q91VW3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bgrl3Q91VW3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bgrl3Q91VW3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bgrl3Q91VW3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrl3Q91VW3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bgrl3Q91VW3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bgrl3Q91VW3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrl3Q91VW3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bgrl3Q91VW3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bgrl3Q91VW3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrl3Q91VW3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrl3Q91VW3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrl3Q91VW3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bgrl3Q91VW3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrl3Q91VW3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bgrl3Q91VW3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bgrl3Q91VW3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bgrl3Q91VW3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bgrl3Q91VW3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bgrl3Q91VW3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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