RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C PHO13P19881 312 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C OXP1P28273 1286 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SLD2P34252 453 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YHL041WP38730 149 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YEL028WP39989 153 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C LTP1P40347 161 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C REF2P42073 533 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C FET5P43561 622 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C MNN11P46985 422 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SET2P46995 733 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YJR124CP47159 448 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C ASN2P49090 572 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C NRM1P53718 249 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SNO2P53823 222 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YLR456WQ06199 204 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RTT10Q08924 1013 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C GNT1Q12096 491 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C AFI1Q99222 893 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C IZH4Q99393 312 aa7.13□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C GAL4P04386 881 aa7.12□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C POL30P15873 258 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C MSP1P28737 362 aa7.12□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C ALY1P36117 915 aa7.12□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C NCL1P38205 684 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C MUM2P38236 366 aa7.12□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YPR114WQ06107 315 aa7.12□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C MEC1P38111 2368 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C LEU1P07264 779 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SBP1P10080 294 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SEC23P15303 768 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C PAT1P25644 796 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C WBP1P33767 430 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C TAE1P38340 232 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RRP3P38712 501 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C AIM18P38884 321 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C DJP1P40564 432 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RRT5P43607 289 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RPS10BP46784 105 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YGR021WP53212 290 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C VPS9P54787 451 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SSL2Q00578 843 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C PPN1Q04119 674 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SWC7Q06707 132 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C THI73Q07904 523 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RRP6Q12149 733 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RKM5Q12367 367 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YOR338WQ99326 363 aa7.11□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C INH1P01097 85 aa7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SPT15P13393 240 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C TEC1P18412 486 aa7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C BRF1P29056 596 aa7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YBR238CP38330 731 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C BIT2P38346 545 aa7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C PAN6P40459 309 aa7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YIL108WP40483 696 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C IST3P40565 148 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C MVP1P40959 511 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RFX1P48743 811 aa7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data7.1□□□□□ -1.27not detected
SPE3YPR069C ATG16Q03818 150 aa7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YML096WQ04489 525 aa7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C IVY1Q04934 453 aa7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C TPO1Q07824 586 aa7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C CMS1Q07897 291 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C OCA6Q12454 224 aa7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RIP1P08067 215 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SCH9P11792 824 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SPO12P17123 173 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C CLC1P17891 233 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C PMA2P19657 947 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C AIM26P32858 118 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C TGL4P36165 910 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C KHA1P40309 873 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SIP4P46954 829 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C NBP35P52920 328 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SPC105P53148 917 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C VPS75P53853 264 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YMR018WQ04364 514 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C BNA5Q05979 453 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C ATG10Q07879 167 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YOR238WQ08634 303 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C PGC1Q08959 321 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C SEY1Q99287 776 aa7.09□□□□□ -1.27
SPE3YPR069C YKR104WP0CE69 306 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C SNT1P25357 1226 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C MEI4P29467 408 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C MCM2P29469 868 aa7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C HXT3P32466 567 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SPE3YPR069C BLI1P35727 113 aa7.08□□□□□ -1.28
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