RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W SUB1P54000 292 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W GCN5Q03330 439 aa9.57□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W ADI1Q03677 179 aa9.57□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W SWC7Q06707 132 aa9.57□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W YCL068CP25593 260 aa9.56□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W SMI1P32566 505 aa9.56□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W ECM13P38195 257 aa9.56□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W SSP120P39931 234 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W JHD1P40034 492 aa9.56□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W MMF1P40185 145 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W UBX4P54730 416 aa9.56□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W MET14Q02196 202 aa9.56□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W BAS1P22035 811 aa9.55□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W PAT1P25644 796 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W NDI1P32340 513 aa9.55□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W HSM3P38348 480 aa9.55□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W HST2P53686 357 aa9.55□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W LDB17Q12342 491 aa9.55□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W YEL077CQ3E7X8 1277 aa9.55□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W ENO2P00925 437 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W YMR085WP0CF18 432 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W APE1P14904 514 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W AAD3P25612 363 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W MCM5P29496 775 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W MRS6P32864 603 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W COY1P34237 679 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W KAP104P38217 918 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W URA8P38627 578 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W PEP8P40335 379 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W RSC8P43609 557 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W DLD2P46681 530 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W CCT8P47079 568 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W MET13P53128 600 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W GND2P53319 492 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W PIR3Q03180 325 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W SLD7Q08457 257 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W MNL2Q12205 849 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W NDJ1Q12366 352 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W SPE4Q12455 300 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W AFI1Q99222 893 aa9.54□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W COX5AP00424 153 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W MIS1P09440 975 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W INO1P11986 533 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W ARG1P22768 420 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W RAD16P31244 790 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W MRE11P32829 692 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W CYM1P32898 989 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W RDH54P38086 958 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W ELO3P40319 345 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W YIR016WP40572 265 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W RCF2P53721 224 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W YDR338CQ05497 695 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W CDC123Q05791 360 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W KCS1Q12494 1050 aa9.53□□□□□ -0.88
BRR1YPR057W PMR1P13586 950 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W PRP4P20053 465 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W HRR25P29295 494 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RIM1P32445 135 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W SEC6P32844 805 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W BEM3P32873 1128 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W SRP68P38687 599 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YJL206CP39529 758 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W NUP60P39705 539 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W VAC8P39968 578 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W KTR7P40504 517 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YNL058CP53947 316 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W SIW14P53965 281 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W SPC24Q04477 213 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RSC2Q06488 889 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W PIB1Q06651 286 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W OCA6Q12454 224 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YPT6Q99260 215 aa9.52□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W HIP1P06775 603 aa9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W PDE1P22434 369 aa9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W PDB1P32473 366 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RRP14P36080 434 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W CRP1P38845 465 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RRN7P40992 514 aa9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W UFE1P41834 346 aa9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W TAN1P53072 289 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W UTP8P53276 713 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W HEH2Q03281 663 aa9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W YMR209CQ03648 457 aa9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W NHX1Q04121 633 aa9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W PGC1Q08959 321 aa9.51□□□□□ -0.89
BRR1YPR057W RGS2Q99188 309 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.8 ms