RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	GRX7	P38068	203 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	SWC5	P38326	303 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YHL049C	P38722	271 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	VPS29	P38759	282 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	MLH1	P38920	769 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YEL075C	P39972	122 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YER189W	P40104	122 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	SER33	P40510	469 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YFL064C	P43540	174 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	TIM54	P47045	478 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	LOH1	P47055	219 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YNL193W	P53870	558 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YPL034W	Q03083	165 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.88	□□□□□ -1.79	not detected
RPO31	YOR116C	NSL1	Q12143	216 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	HSP42	Q12329	375 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	RPN6	Q12377	434 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	PTC5	Q12511	572 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YOS9	Q99220	542 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	RAD27	P26793	382 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	PLC1	P32383	869 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	EUG1	P32474	517 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	VHC1	P38329	1120 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	SIC1	P38634	284 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	MSC7	P38694	644 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	PPX1	P38698	397 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	GCV2	P49095	1034 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	IVY1	Q04934	453 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YPD1	Q07688	167 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	TRE1	Q08919	783 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	MAM3	Q12296	706 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	LDB17	Q12342	491 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	TSR4	P25040	408 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	ETR1	P38071	380 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	HPM1	P40481	377 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	ELP2	P42935	788 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	FAR7	P43592	221 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	CLA4	P48562	842 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	RET3	P53600	189 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YNL260C	P53846	198 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	TEP1	P53916	434 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	CWC27	Q02770	301 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	UGO1	Q03327	502 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	AVO1	Q08236	1176 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	DBF2	P22204	572 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	RNP1	P32385	249 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	RER2	P35196	286 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	CAF4	P36130	643 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	ORC6	P38826	435 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YFL066C	P43538	392 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	IRC6	P43615	237 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	YJL045W	P47052	634 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	NUP84	P52891	726 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	DAM1	P53267	343 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	GAD1	Q04792	585 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	UBR2	Q07963	1872 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	HEM2	P05373	342 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	NUC1	P08466	329 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	RGR1	P19263	1082 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	RAD16	P31244	790 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	DSF2	P38213	736 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	OSH7	P38755	437 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	ATM1	P40416	690 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	SYG1	P40528	902 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	GYP8	P43570	497 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	COG5	P53951	403 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	SLY1	P22213	666 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	CTR86	P25355	563 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	HES1	P35843	434 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	CDS1	P38221	457 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	STP2	P38704	541 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	FTR1	P40088	404 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	KHA1	P40309	873 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPO31	YOR116C	MRPS18	P42847	217 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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