RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MDL2	P33311	773 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	TGL1	P34163	548 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SWH1	P35845	1188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	EMC3	P36039	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MIC60	P36112	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SIF2	P38262	535 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	RIM11	P38615	370 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	EFM4	P40516	257 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ALY2	P47029	1046 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	GCV1	P48015	400 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	CTF18	P49956	741 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	CUL3	P53202	744 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	TOF1	P53840	1238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	GIM3	P53900	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PNG1	Q02890	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ATP25	Q03153	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PSF3	Q12146	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ADH4	P10127	382 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	BET2	P20133	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	CLB1	P24868	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	DMC1	P25453	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MSP1	P28737	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SPC110	P32380	944 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SUR1	P33300	382 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ADD66	P36040	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SWD1	P39706	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MPH1	P40562	993 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MMM1	P41800	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	THI6	P41835	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
YRA2	YKL214C	MET12	P46151	657 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	AVT1	P47082	602 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YBP2	P53169	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YGR266W	P53326	701 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	GAL7	P08431	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	COY1	P34237	679 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SET3	P36124	751 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YJR061W	P40355	935 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	AIM20	P40451	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	CTH1	P47976	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ALT1	P52893	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	TEL2	P53038	688 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	DSD1	P53095	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	VPS75	P53853	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	TOF2	Q02208	771 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YIG1	Q08956	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	GNT1	Q12096	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	GPM3	Q12326	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	APM4	Q99186	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SRB8	P25648	1427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	APE1	P14904	514 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YRA2	YKL214C	STE13	P33894	931 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PCH2	P38126	564 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	EXO5	P38289	585 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MUP3	P38734	546 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PRM2	P40534	656 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YFL052W	P43551	465 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MRX6	P48564	524 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SNF12	P53628	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ARP5	P53946	755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YSP2	Q06681	1438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ENV7	Q12003	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	TGL5	Q12043	749 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PSY3	Q12318	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SKS1	Q12505	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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