RNA–Protein interactions for RNA: YHR065C

RRP3, Transcript of Protein involved in rRNA processing, yeast

Gene RRP3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP3	YHR065C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	KAR3	P17119	729 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	GAC1	P28006	793 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	CSE2	P33308	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	HEL1	P36113	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	MRPL7	P36519	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SWC5	P38326	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	PCA1	P38360	1216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ARG2	P40360	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TMA108	P40462	946 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YFL040W	P43562	540 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	STB4	P50104	949 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	RNT1	Q02555	471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SKY1	Q03656	742 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ESC8	Q08119	714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	VPS54	Q12071	889 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	HAP2	P06774	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	AEP2	P22136	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SLA2	P33338	968 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SLX1	P38324	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ERP2	P39704	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YMR134W	P40207	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YNL320W	P42840	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	NMD5	P46970	1048 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YML6	P51998	286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YGR045C	P53229	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	MUB1	Q03162	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	THI7	Q05998	598 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	MDM38	Q08179	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	EMP46	Q12396	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	VPS5	Q92331	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	PEP5	P12868	1029 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	PLC1	P32383	869 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SRB2	P34162	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	NNK1	P36003	928 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	RPC37	P36121	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	MSG5	P38590	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YHR202W	P38887	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YHR219W	P38900	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	LYS9	P38999	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YIL054W	P40524	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	INA22	P40576	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ECL1	P48235	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	HLJ1	P48353	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SPC98	P53540	846 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TAF9	Q05027	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	STE23	Q06010	1027 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	FMP25	Q08023	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TAF10	Q12030	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YDR018C	Q12185	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	RAD1	P06777	1100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	RAD10	P06838	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ADH4	P10127	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SPO16	P17122	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	NFS1	P25374	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	MET4	P32389	672 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YME1	P32795	747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TKL2	P33315	681 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	LRG1	P35688	1017 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	VHC1	P38329	1120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	POP4	P38336	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	KHA1	P40309	873 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SAP185	P40856	1058 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	PXA1	P41909	870 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	PFD1	P46988	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SLG1	P54867	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	PRM6	Q04705	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	GCR1	P07261	785 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SLY1	P22213	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RRP3	YHR065C	MEI4	P29467	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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