RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	OAR1	P35731	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	PET10	P36139	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	STV1	P37296	890 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	QRI7	P43122	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	LSB1	P53281	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MRPL19	P53875	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	LCD1	Q04377	747 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	PSR1	Q07800	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	ENB1	Q08299	606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	DCS2	Q12123	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SAN1	P22470	610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	RAD16	P31244	790 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SLC1	P33333	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	ERR3	P42222	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YPT11	P48559	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YML6	P51998	286 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YGL138C	P53122	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SOL4	P53315	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CSM3	Q04659	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	UPC2	Q12151	913 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MSS18	P08593	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	ALG1	P16661	449 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	RKM3	P38222	552 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SUL1	P38359	859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	NPR3	P38742	1146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	TDA3	P38758	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SMK1	P41808	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	RET3	P53600	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SKY1	Q03656	742 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	ADE8	P04161	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	GPA1	P08539	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	NGG1	P32494	702 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	PAH1	P32567	862 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MIC60	P36112	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SAW1	P39735	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YER130C	P39959	443 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SIT1	P39980	628 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	BNA2	P47125	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YML122C	Q03207	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MMR1	Q06324	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	PER1	P25625	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	HOG1	P32485	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	XRS2	P33301	854 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	ATG19	P35193	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	OCT1	P35999	772 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	MRPL10	P36520	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YIL166C	P40445	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	LYS14	P40971	790 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	CAF16	P43569	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	NIT3	P49954	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SAP4	P53036	818 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	AIM14	P53109	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	DAM1	P53267	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YKU80	Q04437	629 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP4	YHL004W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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