RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YGR053C	P53234	283 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YGR066C	P53242	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	PSF3	Q12146	194 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	TAH18	Q12181	623 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	PEX28	P38848	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YJR061W	P40355	935 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	FMP32	P43557	207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	DML1	Q03652	475 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	GTB1	Q04924	702 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	UIP4	Q08926	304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	SRM1	P21827	482 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	TAT2	P38967	592 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	MSS4	P38994	779 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	SWP1	Q02795	286 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	RSN1	Q03516	953 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	ESC8	Q08119	714 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	PRB1	P09232	635 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	BIM1	P40013	344 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	SWM2	P40342	146 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YNL146W	P53906	100 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	GCN4	P03069	281 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	PHO91	P27514	894 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	EUG1	P32474	517 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	MRPL17	P36528	281 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	BNA7	Q04066	261 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	SOV1	Q04748	898 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	FAR8	Q05040	523 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	MDM12	Q92328	271 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	TEC1	P18412	486 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	BRE2	P43132	505 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	MPS1	P54199	764 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	ULA1	Q12059	462 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	DAP2	P18962	818 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	KIP1	P28742	1111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
BLM10	YFL007W	MRX3	P38172	270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YHI9	P38765	294 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	DSE1	P40077	573 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	ALF1	P53904	254 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	VPS38	Q05919	439 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	PDR3	P33200	976 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	LOT5	P34234	306 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	MRPL36	P36531	177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	FET3	P38993	636 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YAP5	P40574	245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	TAF12	Q03761	539 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	ARG82	P07250	355 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	CKA1	P15790	372 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	HIR1	P32479	840 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YHL017W	P38745	532 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YER130C	P39959	443 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	UBP7	P40453	1071 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	ASG1	P40467	964 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	ERP6	P53198	216 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	CPS1	P27614	576 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	FRT2	P39734	528 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	AGE2	P40529	298 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	GLC8	P41818	229 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	GOR1	P53839	350 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	PEX15	Q08215	383 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BLM10	YFL007W	CMK2	P22517	447 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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