RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000198437.4

Dclk1-208, Transcript of Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Dclk1, Length 4,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Erdr1	J3QMM0	206 aa		5.79	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ndp	P48744	131 aa		5.79	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Srarp	Q3ULG3	163 aa		5.79	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Trav7d-3	Q5R1I1	112 aa		5.79	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Immp1l	Q9CQU8	166 aa		5.79	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Pcnx2	Q5DU28	2122 aa		5.79	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Usf3	B2RUQ2	2221 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ighv1-23	A0A0A6YVW3	117 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm21983	D6RFS9	131 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	H1fx	Q80ZM5	188 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Triap1	Q9D8Z2	76 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Rnf7	Q9WTZ1	113 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm26938	S4R185	226 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Dock9	Q8BIK4	2055 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ighv5-9	A0A075B5Q2	117 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Brd3os	A0A1B0GRB6	84 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	7530416G11Rik	J3QJX6	159 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Spata46	Q4FZF2	204 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Eif4ebp1	Q60876	117 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Trav7-1	A0A0G2JEV5	112 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Defa1	P11477	93 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Folr2	Q05685	251 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	4933414I15Rik	Q9D4D5	133 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igkv5-37	A0A140T8N4	115 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Defa4	P28311	92 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	A730015C16Rik	Q8C992	119 aa		5.78	□□□□□ -1.48
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ncor2	Q9WU42	2472 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Cysrt1	Q9D1E4	142 aa		5.77	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ighv12-3	A0A075B5T1	117 aa		5.77	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Mrpl36	Q99N90	102 aa		5.77	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Dscam	Q9ERC8	2013 aa		5.77	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Epop	Q7TNS8	369 aa		5.77	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Znf239	P24399	201 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Lox	P28301	411 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm17334	Q8C6U3	126 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Med13	Q5SWW4	2171 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ighv5-4	A0A075B5P9	117 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Serp2	Q6TAW2	65 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Pygo1	Q9D0P5	417 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Wisp2	Q9Z0G4	251 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Cenpe	Q6RT24	2474 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Iglv3	A0A0B4J1K5	122 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ccdc179	J3QM76	67 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Tnfsf12	O54907	249 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Eda2r	Q8BX35	297 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Mamld1	P0C6A2	803 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Lrcol1	Q3URS3	161 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Rpl18a	P62717	176 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Zfp248	Q640N4	576 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Bricd5	Q8BV89	174 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Zfp407	G3UVV3	2246 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Mif	P34884	115 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437		P84751	237 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Prdx2	Q61171	198 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Fxyd4	Q9D2W0	88 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Esm1	Q9QYY7	184 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437		P01729	129 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Fxyd7	P59648	80 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Rab37	Q9JKM7	223 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Obox8	V9GWY9	217 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm10767	Q3TQP0	103 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Tepp	Q6IMH0	216 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm9945	Q8BNZ3	91 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ighv1-7	A0A075B5T7	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ighv1-5	A0A0A6YWG2	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Shisal2a	A2A9G7	189 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm42674	D3YUT9	64 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Klk1b4	P00757	256 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm10645	Q3UPY1	145 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Hilpda	Q9JLS0	64 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Rpl36-ps4	A0A140T8U4	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Kprp	B2RUR4	657 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Vpreb1	P13372	142 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gsx1	P31315	261 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ly6g	P35461	111 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ndufa4	Q62425	82 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Cox6c	Q9CPQ1	76 aa		5.74	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igkv1-133	A0A0B4J1H8	120 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm37988	J3QM41	62 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Iapp	P12968	93 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Adipoq	Q60994	247 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Psmb11	Q8BG41	302 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437		Q8R092	253 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Rnf5	O35445	180 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Socs3	O35718	225 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Cdx4	Q07424	282 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Pate4	Q09098	99 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437		Q8VC23	124 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Apc2	Q9Z1K7	2274 aa		5.73	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ighv3-4	A0A0A6YXF1	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Grn	P28798	589 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	BC025920	Q3US60	128 aa		5.72	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ighv5-8	A0A075B676	92 aa		5.72	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ighv13-2	A0A0A6YWN3	119 aa		5.72	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Hbb-b2	P02089	147 aa		5.72	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igf1	P05017	153 aa		5.72	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Foxi2	Q3I5G5	311 aa		5.72	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ptprz1	B9EKR1	2312 aa		5.72	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Vma21-ps	A0A140T8R2	101 aa		5.72	□□□□□ -1.49
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Wdr86	D3Z757	380 aa		5.72	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 147.2 ms