Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTZ1

Rnf7, RING-box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf7Q9WTZ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,33■■■□□ 2,61
Rnf7Q9WTZ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Rnf7Q9WTZ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rnf7Q9WTZ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Rnf7Q9WTZ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Rnf7Q9WTZ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
Rnf7Q9WTZ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Rnf7Q9WTZ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Rnf7Q9WTZ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Rnf7Q9WTZ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Rnf7Q9WTZ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Rnf7Q9WTZ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Rnf7Q9WTZ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Rnf7Q9WTZ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,28■■□□□ 1,8
Rnf7Q9WTZ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Rnf7Q9WTZ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Rnf7Q9WTZ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rnf7Q9WTZ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rnf7Q9WTZ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rnf7Q9WTZ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rnf7Q9WTZ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rnf7Q9WTZ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rnf7Q9WTZ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rnf7Q9WTZ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Rnf7Q9WTZ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rnf7Q9WTZ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rnf7Q9WTZ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Rnf7Q9WTZ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rnf7Q9WTZ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rnf7Q9WTZ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Rnf7Q9WTZ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rnf7Q9WTZ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Rnf7Q9WTZ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rnf7Q9WTZ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Rnf7Q9WTZ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Rnf7Q9WTZ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rnf7Q9WTZ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rnf7Q9WTZ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Rnf7Q9WTZ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Rnf7Q9WTZ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Rnf7Q9WTZ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Rnf7Q9WTZ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Rnf7Q9WTZ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Rnf7Q9WTZ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Rnf7Q9WTZ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Rnf7Q9WTZ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Rnf7Q9WTZ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Rnf7Q9WTZ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Rnf7Q9WTZ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Rnf7Q9WTZ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Rnf7Q9WTZ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Rnf7Q9WTZ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Rnf7Q9WTZ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Rnf7Q9WTZ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Rnf7Q9WTZ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Rnf7Q9WTZ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,33■■□□□ 1,49
Rnf7Q9WTZ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Rnf7Q9WTZ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Rnf7Q9WTZ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Rnf7Q9WTZ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Rnf7Q9WTZ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Rnf7Q9WTZ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Rnf7Q9WTZ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Rnf7Q9WTZ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Rnf7Q9WTZ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Rnf7Q9WTZ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Rnf7Q9WTZ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Rnf7Q9WTZ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Rnf7Q9WTZ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,02■■□□□ 1,44
Rnf7Q9WTZ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Rnf7Q9WTZ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Rnf7Q9WTZ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Rnf7Q9WTZ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Rnf7Q9WTZ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Rnf7Q9WTZ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Rnf7Q9WTZ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,9■■□□□ 1,42
Rnf7Q9WTZ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Rnf7Q9WTZ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Rnf7Q9WTZ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Rnf7Q9WTZ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Rnf7Q9WTZ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Rnf7Q9WTZ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Rnf7Q9WTZ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,7■■□□□ 1,38
Rnf7Q9WTZ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Rnf7Q9WTZ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Rnf7Q9WTZ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Rnf7Q9WTZ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Rnf7Q9WTZ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Rnf7Q9WTZ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Rnf7Q9WTZ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,48■■□□□ 1,35
Rnf7Q9WTZ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Rnf7Q9WTZ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Rnf7Q9WTZ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rnf7Q9WTZ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rnf7Q9WTZ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rnf7Q9WTZ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rnf7Q9WTZ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Rnf7Q9WTZ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Rnf7Q9WTZ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Rnf7Q9WTZ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,7 ms