Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ighv3-4A0A0A6YXF1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ighv3-4A0A0A6YXF1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ighv3-4A0A0A6YXF1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ighv3-4A0A0A6YXF1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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