Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfp248Q640N4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Zfp248Q640N4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp248Q640N4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp248Q640N4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp248Q640N4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp248Q640N4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp248Q640N4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp248Q640N4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp248Q640N4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp248Q640N4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp248Q640N4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp248Q640N4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp248Q640N4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp248Q640N4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp248Q640N4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp248Q640N4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp248Q640N4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp248Q640N4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp248Q640N4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp248Q640N4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp248Q640N4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp248Q640N4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp248Q640N4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp248Q640N4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp248Q640N4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp248Q640N4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp248Q640N4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp248Q640N4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp248Q640N4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp248Q640N4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp248Q640N4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp248Q640N4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp248Q640N4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp248Q640N4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp248Q640N4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp248Q640N4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp248Q640N4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp248Q640N4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp248Q640N4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp248Q640N4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp248Q640N4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp248Q640N4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp248Q640N4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp248Q640N4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp248Q640N4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp248Q640N4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp248Q640N4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp248Q640N4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp248Q640N4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp248Q640N4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp248Q640N4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp248Q640N4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp248Q640N4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp248Q640N4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp248Q640N4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp248Q640N4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp248Q640N4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp248Q640N4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp248Q640N4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp248Q640N4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp248Q640N4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp248Q640N4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp248Q640N4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp248Q640N4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp248Q640N4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp248Q640N4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp248Q640N4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp248Q640N4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp248Q640N4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp248Q640N4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp248Q640N4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp248Q640N4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp248Q640N4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp248Q640N4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp248Q640N4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp248Q640N4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp248Q640N4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp248Q640N4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp248Q640N4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp248Q640N4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp248Q640N4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp248Q640N4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp248Q640N4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp248Q640N4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp248Q640N4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp248Q640N4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp248Q640N4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp248Q640N4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp248Q640N4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp248Q640N4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp248Q640N4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp248Q640N4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp248Q640N4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp248Q640N4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp248Q640N4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zfp248Q640N4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp248Q640N4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp248Q640N4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp248Q640N4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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