Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q2

Ighv5-9, Immunoglobulin heavy variable 5-9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,75■■■□□ 2,67
Ighv5-9A0A075B5Q2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ighv5-9A0A075B5Q2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ighv5-9A0A075B5Q2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Ighv5-9A0A075B5Q2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ighv5-9A0A075B5Q2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ighv5-9A0A075B5Q2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Ighv5-9A0A075B5Q2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ighv5-9A0A075B5Q2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Ighv5-9A0A075B5Q2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,2■■□□□ 1,79
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ighv5-9A0A075B5Q2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Ighv5-9A0A075B5Q2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ighv5-9A0A075B5Q2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ighv5-9A0A075B5Q2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ighv5-9A0A075B5Q2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Ighv5-9A0A075B5Q2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ighv5-9A0A075B5Q2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1,59
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Ighv5-9A0A075B5Q2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Ighv5-9A0A075B5Q2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ighv5-9A0A075B5Q2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Ighv5-9A0A075B5Q2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Ighv5-9A0A075B5Q2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,52■■□□□ 1,52
Ighv5-9A0A075B5Q2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Ighv5-9A0A075B5Q2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Ighv5-9A0A075B5Q2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ighv5-9A0A075B5Q2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Ighv5-9A0A075B5Q2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Ighv5-9A0A075B5Q2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,21■■□□□ 1,47
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ighv5-9A0A075B5Q2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ighv5-9A0A075B5Q2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ighv5-9A0A075B5Q2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Ighv5-9A0A075B5Q2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ighv5-9A0A075B5Q2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ighv5-9A0A075B5Q2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
Ighv5-9A0A075B5Q2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ighv5-9A0A075B5Q2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,82■■□□□ 1,4
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ighv5-9A0A075B5Q2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ighv5-9A0A075B5Q2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ighv5-9A0A075B5Q2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ighv5-9A0A075B5Q2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,48■■□□□ 1,35
Ighv5-9A0A075B5Q2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ighv5-9A0A075B5Q2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ighv5-9A0A075B5Q2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ighv5-9A0A075B5Q2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,9 ms