Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU28

Pcnx2, Pecanex-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcnx2Q5DU28 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
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Pcnx2Q5DU28 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcnx2Q5DU28 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcnx2Q5DU28 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcnx2Q5DU28 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcnx2Q5DU28 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pcnx2Q5DU28 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcnx2Q5DU28 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcnx2Q5DU28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcnx2Q5DU28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcnx2Q5DU28 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcnx2Q5DU28 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcnx2Q5DU28 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcnx2Q5DU28 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcnx2Q5DU28 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pcnx2Q5DU28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pcnx2Q5DU28 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcnx2Q5DU28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcnx2Q5DU28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcnx2Q5DU28 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcnx2Q5DU28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcnx2Q5DU28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcnx2Q5DU28 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcnx2Q5DU28 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcnx2Q5DU28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcnx2Q5DU28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcnx2Q5DU28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcnx2Q5DU28 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcnx2Q5DU28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcnx2Q5DU28 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pcnx2Q5DU28 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Pcnx2Q5DU28 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcnx2Q5DU28 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcnx2Q5DU28 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcnx2Q5DU28 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcnx2Q5DU28 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcnx2Q5DU28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcnx2Q5DU28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcnx2Q5DU28 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcnx2Q5DU28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcnx2Q5DU28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcnx2Q5DU28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcnx2Q5DU28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcnx2Q5DU28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcnx2Q5DU28 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcnx2Q5DU28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcnx2Q5DU28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcnx2Q5DU28 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcnx2Q5DU28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcnx2Q5DU28 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcnx2Q5DU28 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcnx2Q5DU28 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcnx2Q5DU28 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
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Pcnx2Q5DU28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcnx2Q5DU28 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcnx2Q5DU28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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Pcnx2Q5DU28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcnx2Q5DU28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcnx2Q5DU28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcnx2Q5DU28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcnx2Q5DU28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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Pcnx2Q5DU28 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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Pcnx2Q5DU28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcnx2Q5DU28 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcnx2Q5DU28 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcnx2Q5DU28 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcnx2Q5DU28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcnx2Q5DU28 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcnx2Q5DU28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcnx2Q5DU28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcnx2Q5DU28 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcnx2Q5DU28 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcnx2Q5DU28 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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Pcnx2Q5DU28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcnx2Q5DU28 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcnx2Q5DU28 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcnx2Q5DU28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcnx2Q5DU28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcnx2Q5DU28 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcnx2Q5DU28 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcnx2Q5DU28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcnx2Q5DU28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcnx2Q5DU28 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcnx2Q5DU28 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcnx2Q5DU28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms