RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561332.1

CCDC33-210, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC33, Length 820 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.74□□□□□ -1.33
CCDC33-210ENST00000561332 CCDC179H3BU77 68 aa6.74□□□□□ -1.33
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.73□□□□□ -1.33
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.72□□□□□ -1.33
CCDC33-210ENST00000561332 NDUFC1O43677 76 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC33-210ENST00000561332 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC33-210ENST00000561332 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC33-210ENST00000561332 A8MUN3 132 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC33-210ENST00000561332 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC33-210ENST00000561332 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC33-210ENST00000561332 H7BZZ5 65 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC33-210ENST00000561332 DMAC1Q96GE9 116 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC33-210ENST00000561332 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC33-210ENST00000561332 MT2AP02795 61 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC33-210ENST00000561332 PCP4P48539 62 aa6.61□□□□□ -1.35
CCDC33-210ENST00000561332 ACYP2P14621 99 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.6□□□□□ -1.35
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.58□□□□□ -1.36
CCDC33-210ENST00000561332 S4R3F8 94 aa6.58□□□□□ -1.36
CCDC33-210ENST00000561332 MT1FP04733 61 aa6.57□□□□□ -1.36
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP10-10P60014 251 aa6.56□□□□□ -1.36
CCDC33-210ENST00000561332 LCA10Q71F78 164 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC33-210ENST00000561332 LCE3BQ5TA77 95 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC33-210ENST00000561332 TMEM258P61165 79 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC33-210ENST00000561332 CSAG1Q6PB30 78 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC33-210ENST00000561332 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCDC33-210ENST00000561332 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-210ENST00000561332 COA5Q86WW8 74 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-210ENST00000561332 USH2AO75445 5202 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC33-210ENST00000561332 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.42□□□□□ -1.38
CCDC33-210ENST00000561332 SSPOA2VEC9 5147 aa6.35□□□□□ -1.39
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC33-210ENST00000561332 SVIPQ8NHG7 77 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC33-210ENST00000561332 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.31□□□□□ -1.4
CCDC33-210ENST00000561332 H0YAA0 97 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC33-210ENST00000561332 LCE4AQ5TA78 99 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC33-210ENST00000561332 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.26□□□□□ -1.41
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.24□□□□□ -1.41
CCDC33-210ENST00000561332 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCDC33-210ENST00000561332 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCDC33-210ENST00000561332 SEC61GP60059 68 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC33-210ENST00000561332 P0C880 135 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC33-210ENST00000561332 CRIPTQ9P021 101 aa6.15□□□□□ -1.42
CCDC33-210ENST00000561332 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC33-210ENST00000561332 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC33-210ENST00000561332 A0A1B0GU69 56 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC33-210ENST00000561332 LCE1DQ5T752 114 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC33-210ENST00000561332 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC33-210ENST00000561332 Q5VV11 94 aa6.08□□□□□ -1.44
CCDC33-210ENST00000561332 PRR15LQ9BU68 103 aa6.08□□□□□ -1.44
CCDC33-210ENST00000561332 V9GYY9 64 aa6.08□□□□□ -1.44
CCDC33-210ENST00000561332 Q1T7F1 81 aa6.06□□□□□ -1.44
CCDC33-210ENST00000561332 MT1BP07438 61 aa6.05□□□□□ -1.44
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.05□□□□□ -1.44
CCDC33-210ENST00000561332 R4GN34 69 aa6.05□□□□□ -1.44
CCDC33-210ENST00000561332 M0QZ58 72 aa6.03□□□□□ -1.44
CCDC33-210ENST00000561332 A0A1B0GU33 70 aa6.02□□□□□ -1.45
CCDC33-210ENST00000561332 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CCDC33-210ENST00000561332 A6NN06 94 aa5.97□□□□□ -1.45
CCDC33-210ENST00000561332 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.96□□□□□ -1.46
CCDC33-210ENST00000561332 PSPHP1O15172 72 aa5.95□□□□□ -1.46
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC33-210ENST00000561332 LINC01554Q52M75 96 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC33-210ENST00000561332 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC33-210ENST00000561332 UQCR11O14957 56 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP10-5P60370 271 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.86□□□□□ -1.47
CCDC33-210ENST00000561332 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.85□□□□□ -1.47
CCDC33-210ENST00000561332 A0A0D9SG42 100 aa5.83□□□□□ -1.48
CCDC33-210ENST00000561332 PLAC4Q8WY50 150 aa5.83□□□□□ -1.48
CCDC33-210ENST00000561332 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.8□□□□□ -1.48
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.79□□□□□ -1.48
CCDC33-210ENST00000561332 A6NED7 52 aa5.78□□□□□ -1.48
CCDC33-210ENST00000561332 A8MU10 97 aa5.78□□□□□ -1.48
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.77□□□□□ -1.49
CCDC33-210ENST00000561332 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.75□□□□□ -1.49
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.74□□□□□ -1.49
CCDC33-210ENST00000561332 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.73□□□□□ -1.49
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP12-1P59990 96 aa5.72□□□□□ -1.49
CCDC33-210ENST00000561332 MT1XP80297 61 aa5.7□□□□□ -1.5
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP12-2P59991 146 aa5.68□□□□□ -1.5
CCDC33-210ENST00000561332 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.64□□□□□ -1.51
CCDC33-210ENST00000561332 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.63□□□□□ -1.51
CCDC33-210ENST00000561332 K7ERS5 55 aa5.6□□□□□ -1.51
CCDC33-210ENST00000561332 NEBP20929 6669 aa5.58□□□□□ -1.52
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP5-9P26371 169 aa5.56□□□□□ -1.52
CCDC33-210ENST00000561332 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.54□□□□□ -1.52
CCDC33-210ENST00000561332 KMT2DO14686 5537 aa5.52□□□□□ -1.53
CCDC33-210ENST00000561332 BRK1Q8WUW1 75 aa5.5□□□□□ -1.53
CCDC33-210ENST00000561332 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.49□□□□□ -1.53
CCDC33-210ENST00000561332 A0A0A0MQY5 61 aa5.47□□□□□ -1.53
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