RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526493.1

UBASH3B-204, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 3

Gene UBASH3B, Length 1,163 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-204ENST00000526493 HERC1Q15751 4861 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-204ENST00000526493 MUC17Q685J3 4493 aa6.84□□□□□ -1.31
UBASH3B-204ENST00000526493 SPINK7P58062 85 aa6.84□□□□□ -1.31
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.81□□□□□ -1.32
UBASH3B-204ENST00000526493 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.8□□□□□ -1.32
UBASH3B-204ENST00000526493 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.76□□□□□ -1.33
UBASH3B-204ENST00000526493 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBASH3B-204ENST00000526493 C4orf26Q17RF5 130 aa6.75□□□□□ -1.33
UBASH3B-204ENST00000526493 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
UBASH3B-204ENST00000526493 DMAC1Q96GE9 116 aa6.74□□□□□ -1.33
UBASH3B-204ENST00000526493 LCE4AQ5TA78 99 aa6.72□□□□□ -1.33
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-204ENST00000526493 ACYP2P14621 99 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-204ENST00000526493 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-204ENST00000526493 COA5Q86WW8 74 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.67□□□□□ -1.34
UBASH3B-204ENST00000526493 A8MUN3 132 aa6.66□□□□□ -1.34
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.66□□□□□ -1.34
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.66□□□□□ -1.34
UBASH3B-204ENST00000526493 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.65□□□□□ -1.34
UBASH3B-204ENST00000526493 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.58□□□□□ -1.36
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.57□□□□□ -1.36
UBASH3B-204ENST00000526493 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.56□□□□□ -1.36
UBASH3B-204ENST00000526493 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.55□□□□□ -1.36
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.54□□□□□ -1.36
UBASH3B-204ENST00000526493 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.52□□□□□ -1.37
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.5□□□□□ -1.37
UBASH3B-204ENST00000526493 RNF213Q63HN8 5207 aa6.46□□□□□ -1.37
UBASH3B-204ENST00000526493 Q1T7F1 81 aa6.46□□□□□ -1.38
UBASH3B-204ENST00000526493 S4R3F8 94 aa6.46□□□□□ -1.38
UBASH3B-204ENST00000526493 LCA10Q71F78 164 aa6.45□□□□□ -1.38
UBASH3B-204ENST00000526493 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.44□□□□□ -1.38
UBASH3B-204ENST00000526493 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.44□□□□□ -1.38
UBASH3B-204ENST00000526493 MUC2Q02817 5179 aa6.43□□□□□ -1.38
UBASH3B-204ENST00000526493 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.43□□□□□ -1.38
UBASH3B-204ENST00000526493 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.42□□□□□ -1.38
UBASH3B-204ENST00000526493 V9GYY9 64 aa6.41□□□□□ -1.38
UBASH3B-204ENST00000526493 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.36□□□□□ -1.39
UBASH3B-204ENST00000526493 PRR15LQ9BU68 103 aa6.34□□□□□ -1.39
UBASH3B-204ENST00000526493 PSPHP1O15172 72 aa6.33□□□□□ -1.4
UBASH3B-204ENST00000526493 CSAG1Q6PB30 78 aa6.31□□□□□ -1.4
UBASH3B-204ENST00000526493 Q5VV11 94 aa6.3□□□□□ -1.4
UBASH3B-204ENST00000526493 A0A1B0GU69 56 aa6.29□□□□□ -1.4
UBASH3B-204ENST00000526493 SEC61GP60059 68 aa6.24□□□□□ -1.41
UBASH3B-204ENST00000526493 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.21□□□□□ -1.41
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
UBASH3B-204ENST00000526493 MT1HP80294 61 aa6.19□□□□□ -1.42
UBASH3B-204ENST00000526493 H0YAA0 97 aa6.18□□□□□ -1.42
UBASH3B-204ENST00000526493 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.18□□□□□ -1.42
UBASH3B-204ENST00000526493 P0C880 135 aa6.16□□□□□ -1.42
UBASH3B-204ENST00000526493 A6NED7 52 aa6.13□□□□□ -1.43
UBASH3B-204ENST00000526493 A0A1B0GU33 70 aa6.12□□□□□ -1.43
UBASH3B-204ENST00000526493 UQCR11O14957 56 aa6.1□□□□□ -1.43
UBASH3B-204ENST00000526493 M0R2T5 61 aa6.08□□□□□ -1.44
UBASH3B-204ENST00000526493 A8MU10 97 aa6.05□□□□□ -1.44
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UBASH3B-204ENST00000526493 BRK1Q8WUW1 75 aa6.05□□□□□ -1.44
UBASH3B-204ENST00000526493 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.04□□□□□ -1.44
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.04□□□□□ -1.44
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UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.98□□□□□ -1.45
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.97□□□□□ -1.45
UBASH3B-204ENST00000526493 M0QZ58 72 aa5.97□□□□□ -1.45
UBASH3B-204ENST00000526493 MT2AP02795 61 aa5.95□□□□□ -1.46
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.94□□□□□ -1.46
UBASH3B-204ENST00000526493 R4GN34 69 aa5.93□□□□□ -1.46
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UBASH3B-204ENST00000526493 CRIPTQ9P021 101 aa5.91□□□□□ -1.46
UBASH3B-204ENST00000526493 PRO0628Q9UI54 55 aa5.91□□□□□ -1.46
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UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP10-10P60014 251 aa5.88□□□□□ -1.47
UBASH3B-204ENST00000526493 LINC01554Q52M75 96 aa5.82□□□□□ -1.48
UBASH3B-204ENST00000526493 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.82□□□□□ -1.48
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP12-1P59990 96 aa5.8□□□□□ -1.48
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP12-2P59991 146 aa5.78□□□□□ -1.48
UBASH3B-204ENST00000526493 A6NN06 94 aa5.74□□□□□ -1.49
UBASH3B-204ENST00000526493 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.74□□□□□ -1.49
UBASH3B-204ENST00000526493 K7ERS5 55 aa5.73□□□□□ -1.49
UBASH3B-204ENST00000526493 PMAIP1Q13794 54 aa5.71□□□□□ -1.5
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.68□□□□□ -1.5
UBASH3B-204ENST00000526493 A0A0A0MQY5 61 aa5.67□□□□□ -1.5
UBASH3B-204ENST00000526493 MT1BP07438 61 aa5.61□□□□□ -1.51
UBASH3B-204ENST00000526493 PLAC4Q8WY50 150 aa5.58□□□□□ -1.52
UBASH3B-204ENST00000526493 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.55□□□□□ -1.52
UBASH3B-204ENST00000526493 ROMO1P60602 79 aa5.53□□□□□ -1.52
UBASH3B-204ENST00000526493 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.51□□□□□ -1.53
UBASH3B-204ENST00000526493 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.51□□□□□ -1.53
UBASH3B-204ENST00000526493 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.5□□□□□ -1.53
UBASH3B-204ENST00000526493 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.48□□□□□ -1.53
UBASH3B-204ENST00000526493 USH2AO75445 5202 aa5.48□□□□□ -1.53
UBASH3B-204ENST00000526493 MT1XP80297 61 aa5.42□□□□□ -1.54
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP10-5P60370 271 aa5.41□□□□□ -1.54
UBASH3B-204ENST00000526493 PRAC1Q96KF2 57 aa5.39□□□□□ -1.55
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.32□□□□□ -1.56
UBASH3B-204ENST00000526493 SSPOA2VEC9 5147 aa5.32□□□□□ -1.56
UBASH3B-204ENST00000526493 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.3□□□□□ -1.56
UBASH3B-204ENST00000526493 TNP1P09430 55 aa5.29□□□□□ -1.56
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.25□□□□□ -1.57
UBASH3B-204ENST00000526493 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.2□□□□□ -1.58
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