RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492034.1

POLR1A-209, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-209ENST00000492034 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-209ENST00000492034 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-209ENST00000492034 MUC17Q685J3 4493 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-209ENST00000492034 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-209ENST00000492034 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-209ENST00000492034 S4R3F8 94 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-209ENST00000492034 LCA10Q71F78 164 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-209ENST00000492034 V9GYY9 64 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-209ENST00000492034 CSAG1Q6PB30 78 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-209ENST00000492034 Q1T7F1 81 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-209ENST00000492034 SEC61GP60059 68 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-209ENST00000492034 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-209ENST00000492034 PRR15LQ9BU68 103 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-209ENST00000492034 A0A1B0GU69 56 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1A-209ENST00000492034 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-209ENST00000492034 MUC2Q02817 5179 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-209ENST00000492034 RNF213Q63HN8 5207 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-209ENST00000492034 H0YAA0 97 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-209ENST00000492034 M0R2T5 61 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-209ENST00000492034 PSPHP1O15172 72 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-209ENST00000492034 MT1HP80294 61 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-209ENST00000492034 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-209ENST00000492034 Q5VV11 94 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-209ENST00000492034 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
POLR1A-209ENST00000492034 A0A1B0GU33 70 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-209ENST00000492034 UQCR11O14957 56 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-209ENST00000492034 A6NED7 52 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1A-209ENST00000492034 P0C880 135 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-209ENST00000492034 M0QZ58 72 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-209ENST00000492034 CRIPTQ9P021 101 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-209ENST00000492034 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-209ENST00000492034 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-209ENST00000492034 R4GN34 69 aa6.43□□□□□ -1.38
POLR1A-209ENST00000492034 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.4□□□□□ -1.38
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP10-10P60014 251 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR1A-209ENST00000492034 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.38□□□□□ -1.39
POLR1A-209ENST00000492034 MT2AP02795 61 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1A-209ENST00000492034 BRK1Q8WUW1 75 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1A-209ENST00000492034 MT1FP04733 61 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-209ENST00000492034 A0A0D9SG42 100 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-209ENST00000492034 K7ERS5 55 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-209ENST00000492034 LINC01554Q52M75 96 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-209ENST00000492034 LCE3BQ5TA77 95 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-209ENST00000492034 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-209ENST00000492034 A8MU10 97 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-209ENST00000492034 A6NN06 94 aa6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-209ENST00000492034 PRO0628Q9UI54 55 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.18□□□□□ -1.42
POLR1A-209ENST00000492034 SVIPQ8NHG7 77 aa6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-209ENST00000492034 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.15□□□□□ -1.42
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.15□□□□□ -1.42
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.15□□□□□ -1.42
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.14□□□□□ -1.43
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP12-1P59990 96 aa6.14□□□□□ -1.43
POLR1A-209ENST00000492034 PLAC4Q8WY50 150 aa6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP12-2P59991 146 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-209ENST00000492034 PMAIP1Q13794 54 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1A-209ENST00000492034 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1A-209ENST00000492034 MT1BP07438 61 aa5.97□□□□□ -1.45
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.95□□□□□ -1.46
POLR1A-209ENST00000492034 ROMO1P60602 79 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1A-209ENST00000492034 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-209ENST00000492034 LCE1DQ5T752 114 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1A-209ENST00000492034 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.79□□□□□ -1.48
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP10-5P60370 271 aa5.76□□□□□ -1.49
POLR1A-209ENST00000492034 MT1XP80297 61 aa5.76□□□□□ -1.49
POLR1A-209ENST00000492034 TNP1P09430 55 aa5.74□□□□□ -1.49
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.74□□□□□ -1.49
POLR1A-209ENST00000492034 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.74□□□□□ -1.49
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.74□□□□□ -1.49
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1A-209ENST00000492034 USH2AO75445 5202 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1A-209ENST00000492034 H3BS24 57 aa5.63□□□□□ -1.51
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.57□□□□□ -1.52
POLR1A-209ENST00000492034 PP632Q6XCG6 107 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1A-209ENST00000492034 PRAC1Q96KF2 57 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1A-209ENST00000492034 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP10-12P60413 245 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1A-209ENST00000492034 LCE4AQ5TA78 99 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1A-209ENST00000492034 SSPOA2VEC9 5147 aa5.47□□□□□ -1.53
POLR1A-209ENST00000492034 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1A-209ENST00000492034 LCE3AQ5TA76 89 aa5.41□□□□□ -1.54
POLR1A-209ENST00000492034 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms