RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.47□□□□□ -1.37
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.46□□□□□ -1.38
NISCH-208ENST00000481211 DMAC1Q96GE9 116 aa6.45□□□□□ -1.38
NISCH-208ENST00000481211 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.44□□□□□ -1.38
NISCH-208ENST00000481211 MT1HP80294 61 aa6.44□□□□□ -1.38
NISCH-208ENST00000481211 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
NISCH-208ENST00000481211 LCE3BQ5TA77 95 aa6.43□□□□□ -1.38
NISCH-208ENST00000481211 CCDC179H3BU77 68 aa6.42□□□□□ -1.38
NISCH-208ENST00000481211 H7BZZ5 65 aa6.41□□□□□ -1.38
NISCH-208ENST00000481211 ACYP2P14621 99 aa6.39□□□□□ -1.39
NISCH-208ENST00000481211 S4R3F8 94 aa6.39□□□□□ -1.39
NISCH-208ENST00000481211 M0R2T5 61 aa6.37□□□□□ -1.39
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.37□□□□□ -1.39
NISCH-208ENST00000481211 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.36□□□□□ -1.39
NISCH-208ENST00000481211 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
NISCH-208ENST00000481211 LCA10Q71F78 164 aa6.32□□□□□ -1.4
NISCH-208ENST00000481211 CSAG1Q6PB30 78 aa6.31□□□□□ -1.4
NISCH-208ENST00000481211 TMEM258P61165 79 aa6.3□□□□□ -1.4
NISCH-208ENST00000481211 PCP4P48539 62 aa6.29□□□□□ -1.4
NISCH-208ENST00000481211 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.27□□□□□ -1.41
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.27□□□□□ -1.41
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.27□□□□□ -1.41
NISCH-208ENST00000481211 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.26□□□□□ -1.41
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
NISCH-208ENST00000481211 COA5Q86WW8 74 aa6.22□□□□□ -1.41
NISCH-208ENST00000481211 H0YAA0 97 aa6.17□□□□□ -1.42
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.16□□□□□ -1.42
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.15□□□□□ -1.42
NISCH-208ENST00000481211 MT2AP02795 61 aa6.11□□□□□ -1.43
NISCH-208ENST00000481211 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.09□□□□□ -1.43
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP10-10P60014 251 aa6.06□□□□□ -1.44
NISCH-208ENST00000481211 MT1FP04733 61 aa6.05□□□□□ -1.44
NISCH-208ENST00000481211 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.04□□□□□ -1.44
NISCH-208ENST00000481211 CRIPTQ9P021 101 aa6.04□□□□□ -1.44
NISCH-208ENST00000481211 SEC61GP60059 68 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-208ENST00000481211 LCE1DQ5T752 114 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-208ENST00000481211 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.95□□□□□ -1.46
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.94□□□□□ -1.46
NISCH-208ENST00000481211 P0C880 135 aa5.93□□□□□ -1.46
NISCH-208ENST00000481211 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.92□□□□□ -1.46
NISCH-208ENST00000481211 A0A1B0GU69 56 aa5.91□□□□□ -1.46
NISCH-208ENST00000481211 PRR15LQ9BU68 103 aa5.91□□□□□ -1.46
NISCH-208ENST00000481211 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.91□□□□□ -1.46
NISCH-208ENST00000481211 V9GYY9 64 aa5.91□□□□□ -1.46
NISCH-208ENST00000481211 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.89□□□□□ -1.47
NISCH-208ENST00000481211 R4GN34 69 aa5.89□□□□□ -1.47
NISCH-208ENST00000481211 M0QZ58 72 aa5.88□□□□□ -1.47
NISCH-208ENST00000481211 LCE4AQ5TA78 99 aa5.86□□□□□ -1.47
NISCH-208ENST00000481211 H3BS24 57 aa5.85□□□□□ -1.47
NISCH-208ENST00000481211 Q1T7F1 81 aa5.84□□□□□ -1.47
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.83□□□□□ -1.48
NISCH-208ENST00000481211 A0A1B0GU33 70 aa5.81□□□□□ -1.48
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-208ENST00000481211 Q5VV11 94 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.79□□□□□ -1.48
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.73□□□□□ -1.49
NISCH-208ENST00000481211 A6NN06 94 aa5.72□□□□□ -1.49
NISCH-208ENST00000481211 UQCR11O14957 56 aa5.7□□□□□ -1.5
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.7□□□□□ -1.5
NISCH-208ENST00000481211 LINC01554Q52M75 96 aa5.69□□□□□ -1.5
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.69□□□□□ -1.5
NISCH-208ENST00000481211 PSPHP1O15172 72 aa5.68□□□□□ -1.5
NISCH-208ENST00000481211 MT1BP07438 61 aa5.68□□□□□ -1.5
NISCH-208ENST00000481211 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.66□□□□□ -1.5
NISCH-208ENST00000481211 PLAC4Q8WY50 150 aa5.66□□□□□ -1.5
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.62□□□□□ -1.51
NISCH-208ENST00000481211 USH2AO75445 5202 aa5.6□□□□□ -1.51
NISCH-208ENST00000481211 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.59□□□□□ -1.51
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.59□□□□□ -1.51
NISCH-208ENST00000481211 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.59□□□□□ -1.51
NISCH-208ENST00000481211 A0A0D9SG42 100 aa5.58□□□□□ -1.52
NISCH-208ENST00000481211 A6NED7 52 aa5.56□□□□□ -1.52
NISCH-208ENST00000481211 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.56□□□□□ -1.52
NISCH-208ENST00000481211 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.53□□□□□ -1.52
NISCH-208ENST00000481211 A8MU10 97 aa5.52□□□□□ -1.53
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP12-1P59990 96 aa5.52□□□□□ -1.53
NISCH-208ENST00000481211 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.5□□□□□ -1.53
NISCH-208ENST00000481211 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.5□□□□□ -1.53
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP10-5P60370 271 aa5.49□□□□□ -1.53
NISCH-208ENST00000481211 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.47□□□□□ -1.53
NISCH-208ENST00000481211 SSPOA2VEC9 5147 aa5.46□□□□□ -1.53
NISCH-208ENST00000481211 K7ERS5 55 aa5.46□□□□□ -1.54
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP12-2P59991 146 aa5.46□□□□□ -1.54
NISCH-208ENST00000481211 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.45□□□□□ -1.54
NISCH-208ENST00000481211 MT1XP80297 61 aa5.43□□□□□ -1.54
NISCH-208ENST00000481211 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
NISCH-208ENST00000481211 BRK1Q8WUW1 75 aa5.27□□□□□ -1.57
NISCH-208ENST00000481211 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.21□□□□□ -1.58
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP10-12P60413 245 aa5.2□□□□□ -1.58
NISCH-208ENST00000481211 TNP1P09430 55 aa5.19□□□□□ -1.58
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
NISCH-208ENST00000481211 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
NISCH-208ENST00000481211 ROMO1P60602 79 aa5.13□□□□□ -1.59
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.13□□□□□ -1.59
NISCH-208ENST00000481211 PRO0628Q9UI54 55 aa5.05□□□□□ -1.6
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.04□□□□□ -1.6
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.03□□□□□ -1.6
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.03□□□□□ -1.6
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP23-1A1A580 65 aa5□□□□□ -1.61
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