RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trav9-2A0A075B647 113 aa18.24■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trav9-4A0A0B4J1K2 113 aa18.24■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm4565A0A140LJ87 301 aa18.24■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Vmn1r158G3UY92 307 aa18.24■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gstp1P19157 210 aa18.24■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmed6Q9CQG0 239 aa18.24■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm12169F2Z474 250 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rnf212F6TQD1 307 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm2564F6Z9S8 108 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 DdtO35215 118 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccl19O70460 108 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ren1P06281 402 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Psmb8P28063 276 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Spink2Q8BMY7 86 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 AhspQ9CY02 102 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ighv2-3A0A075B696 115 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm21874J3QNZ6 232 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cd69P37217 199 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Olfr1437Q7TQR7 312 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Olfr954Q9EQB6 314 aa18.23■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Olfr1116E9PXB8 307 aa18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 S100a10P08207 97 aa18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hist1h2bmP10854 126 aa18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Olfr1537P34983 314 aa18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hist1h2bhQ64478 126 aa18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hist2h2bbQ64525 126 aa18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hist1h2bcQ6ZWY9 126 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 QrfpQ8CE23 124 aa18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Olfr1012Q8VFJ7 311 aa18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tspan4Q9DCK3 238 aa18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nat6Q9R123 314 aa18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Psmg3Q9CZH3 122 aa18.22■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm15056F6ZR08 88 aa18.21■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tnfrsf9P20334 256 aa18.21■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Smim7Q5RKS2 75 aa18.21■□□□□ 0.51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa18.21■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 BC100530Q497J0 97 aa18.21■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Odf3Q920N1 254 aa18.21■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mpv17lQ99MS3 194 aa18.21■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Wfdc2Q9DAU7 174 aa18.21■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fn1P11276 2477 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm3443F7CCV5 94 aa18.2■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fa2hQ5MPP0 372 aa18.2■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Olfr1419Q7TQS2 343 aa18.2■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adcyap1O70176 175 aa18.19■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Q8CF25 301 aa18.19■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tex15F8VPN2 2785 aa18.19■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm21834J3QN05 151 aa18.19■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rhox4gQ2MDF7 205 aa18.19■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rnf152Q8BG47 203 aa18.19■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trav16nA0A075B634 117 aa18.18■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tpt1P63028 172 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 ChtopQ9CY57 249 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Npc2Q9Z0J0 149 aa18.18■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Olfr1320A2AHM8 319 aa18.18■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 F2rl1P55086 399 aa18.18■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 MymxQ2Q5T5 84 aa18.18■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tctex1d1Q9D5I4 173 aa18.17■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 A930003A15RikQ3U552 87 aa18.17■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmem256Q5F285 113 aa18.17■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Olfr317Q5NCD6 327 aa18.17■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plekhb2Q9QZC7 221 aa18.17■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pex7P97865 318 aa18.16■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hivep1Q03172 2688 aa18.16■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 SnrpeP62305 92 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Psmb11Q8BG41 302 aa18.15■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Vmn1r202Q8R259 302 aa18.15■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 MNCb-2875Q9DCB3 74 aa18.15■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arl11Q6P3A9 176 aa18.15■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Stard4Q99JV5 224 aa18.15■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dmbt1Q60997 2085 aa18.15■□□□□ 0.5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm14325A2AW67 498 aa18.14■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Reg3gO09049 174 aa18.14■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Klk1b4P00757 256 aa18.14■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Olfr311Q5NC59 308 aa18.14■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Olfr312Q7TRZ9 308 aa18.14■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Immp2lQ8BPT6 175 aa18.14■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Obox1Q9D350 204 aa18.14■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ighv5-9-1A0A0A6YVS4 126 aa18.13■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 1810032O08RikE9PZV8 113 aa18.13■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 TcapO70548 167 aa18.13■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 SnrpcQ62241 159 aa18.13■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Golt1bQ9CR60 138 aa18.13■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm9047B9EJX3 177 aa18.13■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pafah1b2Q61206 229 aa18.13■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Crip3Q6Q6R3 243 aa18.13■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam216aQ9DB54 251 aa18.13■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 LhbO09108 141 aa18.12■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rbfox3Q8BIF2 374 aa18.12■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Olfr435Q8VFS3 313 aa18.12■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ceacam11Q9D0Z8 303 aa18.12■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgap32Q811P8 2089 aa18.12■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mrps10Q80ZK0 160 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rab4bQ91ZR1 213 aa18.11■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dusp14Q9JLY7 198 aa18.11■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tenm1Q9WTS4 2731 aa18.11■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trav12d-3A0A075B6A4 115 aa18.11■□□□□ 0.49
Odc1-201ENSMUST00000171737 4930474N05RikQ8BVR5 218 aa18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.7 ms