Protein–RNA interactions for Protein: G3UY92

Vmn1r158, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r158G3UY92 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Vmn1r158G3UY92 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn1r158G3UY92 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vmn1r158G3UY92 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r158G3UY92 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r158G3UY92 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vmn1r158G3UY92 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r158G3UY92 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn1r158G3UY92 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn1r158G3UY92 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r158G3UY92 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r158G3UY92 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r158G3UY92 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r158G3UY92 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r158G3UY92 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r158G3UY92 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r158G3UY92 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r158G3UY92 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r158G3UY92 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r158G3UY92 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r158G3UY92 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r158G3UY92 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r158G3UY92 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r158G3UY92 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r158G3UY92 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r158G3UY92 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r158G3UY92 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r158G3UY92 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r158G3UY92 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r158G3UY92 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r158G3UY92 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r158G3UY92 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r158G3UY92 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r158G3UY92 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r158G3UY92 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r158G3UY92 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r158G3UY92 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r158G3UY92 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r158G3UY92 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r158G3UY92 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r158G3UY92 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r158G3UY92 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r158G3UY92 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r158G3UY92 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r158G3UY92 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r158G3UY92 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r158G3UY92 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r158G3UY92 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r158G3UY92 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r158G3UY92 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r158G3UY92 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r158G3UY92 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r158G3UY92 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r158G3UY92 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r158G3UY92 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r158G3UY92 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r158G3UY92 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r158G3UY92 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r158G3UY92 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r158G3UY92 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r158G3UY92 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r158G3UY92 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r158G3UY92 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r158G3UY92 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r158G3UY92 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r158G3UY92 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r158G3UY92 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r158G3UY92 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r158G3UY92 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r158G3UY92 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r158G3UY92 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r158G3UY92 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r158G3UY92 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r158G3UY92 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r158G3UY92 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r158G3UY92 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r158G3UY92 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r158G3UY92 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r158G3UY92 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r158G3UY92 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r158G3UY92 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r158G3UY92 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r158G3UY92 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r158G3UY92 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r158G3UY92 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r158G3UY92 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r158G3UY92 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r158G3UY92 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r158G3UY92 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r158G3UY92 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r158G3UY92 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r158G3UY92 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r158G3UY92 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r158G3UY92 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r158G3UY92 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r158G3UY92 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r158G3UY92 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r158G3UY92 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r158G3UY92 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r158G3UY92 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms