Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tspan4Q9DCK3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tspan4Q9DCK3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tspan4Q9DCK3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tspan4Q9DCK3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tspan4Q9DCK3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tspan4Q9DCK3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tspan4Q9DCK3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tspan4Q9DCK3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tspan4Q9DCK3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tspan4Q9DCK3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan4Q9DCK3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tspan4Q9DCK3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan4Q9DCK3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tspan4Q9DCK3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tspan4Q9DCK3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan4Q9DCK3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tspan4Q9DCK3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tspan4Q9DCK3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tspan4Q9DCK3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tspan4Q9DCK3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tspan4Q9DCK3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan4Q9DCK3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tspan4Q9DCK3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan4Q9DCK3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tspan4Q9DCK3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan4Q9DCK3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan4Q9DCK3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan4Q9DCK3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tspan4Q9DCK3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tspan4Q9DCK3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tspan4Q9DCK3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan4Q9DCK3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan4Q9DCK3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan4Q9DCK3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan4Q9DCK3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan4Q9DCK3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan4Q9DCK3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan4Q9DCK3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tspan4Q9DCK3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan4Q9DCK3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan4Q9DCK3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan4Q9DCK3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan4Q9DCK3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan4Q9DCK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tspan4Q9DCK3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan4Q9DCK3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan4Q9DCK3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan4Q9DCK3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan4Q9DCK3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan4Q9DCK3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan4Q9DCK3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan4Q9DCK3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan4Q9DCK3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan4Q9DCK3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tspan4Q9DCK3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan4Q9DCK3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan4Q9DCK3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan4Q9DCK3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan4Q9DCK3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan4Q9DCK3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan4Q9DCK3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan4Q9DCK3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan4Q9DCK3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan4Q9DCK3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan4Q9DCK3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan4Q9DCK3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan4Q9DCK3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tspan4Q9DCK3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan4Q9DCK3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan4Q9DCK3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan4Q9DCK3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan4Q9DCK3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan4Q9DCK3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan4Q9DCK3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan4Q9DCK3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan4Q9DCK3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan4Q9DCK3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan4Q9DCK3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan4Q9DCK3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan4Q9DCK3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan4Q9DCK3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan4Q9DCK3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan4Q9DCK3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan4Q9DCK3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan4Q9DCK3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan4Q9DCK3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan4Q9DCK3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan4Q9DCK3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan4Q9DCK3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan4Q9DCK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan4Q9DCK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan4Q9DCK3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan4Q9DCK3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan4Q9DCK3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan4Q9DCK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan4Q9DCK3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms