Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Tspan4Q9DCK3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Tspan4Q9DCK3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Tspan4Q9DCK3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Tspan4Q9DCK3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tspan4Q9DCK3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Tspan4Q9DCK3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Tspan4Q9DCK3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Tspan4Q9DCK3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Tspan4Q9DCK3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tspan4Q9DCK3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,97■■□□□ 1,59
Tspan4Q9DCK3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Tspan4Q9DCK3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Tspan4Q9DCK3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Tspan4Q9DCK3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Tspan4Q9DCK3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Tspan4Q9DCK3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Tspan4Q9DCK3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Tspan4Q9DCK3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Tspan4Q9DCK3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Tspan4Q9DCK3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Tspan4Q9DCK3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Tspan4Q9DCK3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Tspan4Q9DCK3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Tspan4Q9DCK3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Tspan4Q9DCK3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Tspan4Q9DCK3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Tspan4Q9DCK3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Tspan4Q9DCK3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,11■■□□□ 1,45
Tspan4Q9DCK3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Tspan4Q9DCK3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Tspan4Q9DCK3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Tspan4Q9DCK3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Tspan4Q9DCK3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Tspan4Q9DCK3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Tspan4Q9DCK3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
Tspan4Q9DCK3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Tspan4Q9DCK3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Tspan4Q9DCK3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Tspan4Q9DCK3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Tspan4Q9DCK3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Tspan4Q9DCK3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Tspan4Q9DCK3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,34■■□□□ 1,33
Tspan4Q9DCK3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,32
Tspan4Q9DCK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Tspan4Q9DCK3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Tspan4Q9DCK3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Tspan4Q9DCK3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Tspan4Q9DCK3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Tspan4Q9DCK3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Tspan4Q9DCK3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Tspan4Q9DCK3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Tspan4Q9DCK3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Tspan4Q9DCK3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Tspan4Q9DCK3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,3
Tspan4Q9DCK3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Tspan4Q9DCK3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Tspan4Q9DCK3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Tspan4Q9DCK3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Tspan4Q9DCK3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Tspan4Q9DCK3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Tspan4Q9DCK3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Tspan4Q9DCK3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Tspan4Q9DCK3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Tspan4Q9DCK3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Tspan4Q9DCK3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,97■■□□□ 1,27
Tspan4Q9DCK3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Tspan4Q9DCK3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Tspan4Q9DCK3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Tspan4Q9DCK3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Tspan4Q9DCK3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
Tspan4Q9DCK3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,84■■□□□ 1,25
Tspan4Q9DCK3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Tspan4Q9DCK3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Tspan4Q9DCK3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Tspan4Q9DCK3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Tspan4Q9DCK3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Tspan4Q9DCK3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Tspan4Q9DCK3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Tspan4Q9DCK3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Tspan4Q9DCK3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Tspan4Q9DCK3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Tspan4Q9DCK3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Tspan4Q9DCK3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Tspan4Q9DCK3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Tspan4Q9DCK3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Tspan4Q9DCK3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Tspan4Q9DCK3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Tspan4Q9DCK3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Tspan4Q9DCK3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Tspan4Q9DCK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Tspan4Q9DCK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Tspan4Q9DCK3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Tspan4Q9DCK3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Tspan4Q9DCK3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Tspan4Q9DCK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Tspan4Q9DCK3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms