Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab4bQ91ZR1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab4bQ91ZR1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab4bQ91ZR1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab4bQ91ZR1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab4bQ91ZR1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab4bQ91ZR1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab4bQ91ZR1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab4bQ91ZR1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab4bQ91ZR1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab4bQ91ZR1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab4bQ91ZR1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab4bQ91ZR1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab4bQ91ZR1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab4bQ91ZR1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab4bQ91ZR1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab4bQ91ZR1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab4bQ91ZR1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab4bQ91ZR1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab4bQ91ZR1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab4bQ91ZR1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab4bQ91ZR1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab4bQ91ZR1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab4bQ91ZR1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab4bQ91ZR1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab4bQ91ZR1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab4bQ91ZR1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab4bQ91ZR1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab4bQ91ZR1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab4bQ91ZR1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab4bQ91ZR1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab4bQ91ZR1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab4bQ91ZR1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab4bQ91ZR1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab4bQ91ZR1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab4bQ91ZR1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab4bQ91ZR1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab4bQ91ZR1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab4bQ91ZR1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab4bQ91ZR1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab4bQ91ZR1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab4bQ91ZR1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab4bQ91ZR1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab4bQ91ZR1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab4bQ91ZR1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab4bQ91ZR1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab4bQ91ZR1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab4bQ91ZR1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab4bQ91ZR1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab4bQ91ZR1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab4bQ91ZR1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab4bQ91ZR1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab4bQ91ZR1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab4bQ91ZR1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab4bQ91ZR1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab4bQ91ZR1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab4bQ91ZR1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab4bQ91ZR1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab4bQ91ZR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab4bQ91ZR1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab4bQ91ZR1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab4bQ91ZR1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab4bQ91ZR1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab4bQ91ZR1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab4bQ91ZR1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab4bQ91ZR1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab4bQ91ZR1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab4bQ91ZR1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab4bQ91ZR1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab4bQ91ZR1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab4bQ91ZR1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab4bQ91ZR1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab4bQ91ZR1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab4bQ91ZR1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab4bQ91ZR1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab4bQ91ZR1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab4bQ91ZR1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab4bQ91ZR1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab4bQ91ZR1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab4bQ91ZR1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab4bQ91ZR1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab4bQ91ZR1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab4bQ91ZR1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab4bQ91ZR1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab4bQ91ZR1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab4bQ91ZR1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab4bQ91ZR1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab4bQ91ZR1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab4bQ91ZR1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab4bQ91ZR1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab4bQ91ZR1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab4bQ91ZR1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab4bQ91ZR1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab4bQ91ZR1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab4bQ91ZR1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab4bQ91ZR1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab4bQ91ZR1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab4bQ91ZR1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab4bQ91ZR1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab4bQ91ZR1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms