Protein–RNA interactions for Protein: O70548

Tcap, Telethonin, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcapO70548 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TcapO70548 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TcapO70548 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TcapO70548 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TcapO70548 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TcapO70548 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TcapO70548 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TcapO70548 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TcapO70548 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TcapO70548 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TcapO70548 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TcapO70548 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TcapO70548 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TcapO70548 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TcapO70548 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TcapO70548 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TcapO70548 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TcapO70548 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TcapO70548 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TcapO70548 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TcapO70548 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TcapO70548 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TcapO70548 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TcapO70548 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TcapO70548 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TcapO70548 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TcapO70548 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TcapO70548 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TcapO70548 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TcapO70548 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TcapO70548 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TcapO70548 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TcapO70548 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TcapO70548 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TcapO70548 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TcapO70548 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TcapO70548 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TcapO70548 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TcapO70548 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TcapO70548 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TcapO70548 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TcapO70548 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TcapO70548 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TcapO70548 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TcapO70548 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TcapO70548 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TcapO70548 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TcapO70548 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TcapO70548 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TcapO70548 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TcapO70548 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TcapO70548 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TcapO70548 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TcapO70548 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TcapO70548 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TcapO70548 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TcapO70548 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TcapO70548 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TcapO70548 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TcapO70548 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TcapO70548 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TcapO70548 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TcapO70548 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TcapO70548 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TcapO70548 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TcapO70548 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TcapO70548 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TcapO70548 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TcapO70548 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TcapO70548 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TcapO70548 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TcapO70548 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TcapO70548 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TcapO70548 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TcapO70548 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TcapO70548 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TcapO70548 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TcapO70548 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TcapO70548 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TcapO70548 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TcapO70548 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TcapO70548 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TcapO70548 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TcapO70548 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TcapO70548 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TcapO70548 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TcapO70548 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TcapO70548 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TcapO70548 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TcapO70548 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TcapO70548 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TcapO70548 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TcapO70548 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TcapO70548 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TcapO70548 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TcapO70548 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TcapO70548 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TcapO70548 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TcapO70548 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TcapO70548 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms