Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Gm2564F6Z9S8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Gm2564F6Z9S8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Gm2564F6Z9S8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Gm2564F6Z9S8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gm2564F6Z9S8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Gm2564F6Z9S8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
Gm2564F6Z9S8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Gm2564F6Z9S8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Gm2564F6Z9S8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Gm2564F6Z9S8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Gm2564F6Z9S8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Gm2564F6Z9S8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,35■■□□□ 1,49
Gm2564F6Z9S8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Gm2564F6Z9S8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Gm2564F6Z9S8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Gm2564F6Z9S8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
Gm2564F6Z9S8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Gm2564F6Z9S8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Gm2564F6Z9S8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Gm2564F6Z9S8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,42■■□□□ 1,34
Gm2564F6Z9S8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Gm2564F6Z9S8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Gm2564F6Z9S8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Gm2564F6Z9S8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Gm2564F6Z9S8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Gm2564F6Z9S8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Gm2564F6Z9S8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gm2564F6Z9S8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,2■■□□□ 1,3
Gm2564F6Z9S8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Gm2564F6Z9S8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Gm2564F6Z9S8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Gm2564F6Z9S8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Gm2564F6Z9S8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Gm2564F6Z9S8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Gm2564F6Z9S8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Gm2564F6Z9S8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
Gm2564F6Z9S8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Gm2564F6Z9S8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Gm2564F6Z9S8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Gm2564F6Z9S8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Gm2564F6Z9S8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Gm2564F6Z9S8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Gm2564F6Z9S8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Gm2564F6Z9S8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Gm2564F6Z9S8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Gm2564F6Z9S8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Gm2564F6Z9S8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Gm2564F6Z9S8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,34■■□□□ 1,17
Gm2564F6Z9S8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Gm2564F6Z9S8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Gm2564F6Z9S8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Gm2564F6Z9S8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Gm2564F6Z9S8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Gm2564F6Z9S8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Gm2564F6Z9S8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Gm2564F6Z9S8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,13
Gm2564F6Z9S8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Gm2564F6Z9S8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Gm2564F6Z9S8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,99■■□□□ 1,11
Gm2564F6Z9S8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Gm2564F6Z9S8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Gm2564F6Z9S8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,93■■□□□ 1,1
Gm2564F6Z9S8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Gm2564F6Z9S8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Gm2564F6Z9S8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Gm2564F6Z9S8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Gm2564F6Z9S8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Gm2564F6Z9S8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Gm2564F6Z9S8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Gm2564F6Z9S8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Gm2564F6Z9S8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
Gm2564F6Z9S8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Gm2564F6Z9S8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Gm2564F6Z9S8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Gm2564F6Z9S8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Gm2564F6Z9S8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,07
Gm2564F6Z9S8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,07
Gm2564F6Z9S8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Gm2564F6Z9S8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Gm2564F6Z9S8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21,61■■□□□ 1,05
Gm2564F6Z9S8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Gm2564F6Z9S8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
Gm2564F6Z9S8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Gm2564F6Z9S8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Gm2564F6Z9S8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Gm2564F6Z9S8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Gm2564F6Z9S8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Gm2564F6Z9S8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Gm2564F6Z9S8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,47■■□□□ 1,03
Gm2564F6Z9S8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Gm2564F6Z9S8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Gm2564F6Z9S8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Gm2564F6Z9S8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21,41■■□□□ 1,02
Gm2564F6Z9S8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Gm2564F6Z9S8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Gm2564F6Z9S8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Gm2564F6Z9S8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Gm2564F6Z9S8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Gm2564F6Z9S8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,33■■□□□ 1,01
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