RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SDH5	Q08230	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	NYV1	Q12255	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	FIG2	P25653	1609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PMR1	P13586	950 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SWI3	P32591	825 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RPC25	P35718	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	MRP8	P35719	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	YKR075C	P36155	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	ERT1	P38140	529 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RTS1	P38903	757 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	YJL206C	P39529	758 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	MRX1	P40050	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	THI6	P41835	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	VTC2	P43585	828 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	ALG2	P43636	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	YGR153W	P48238	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	TEL2	P53038	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	VTI1	Q04338	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	DAS2	Q12084	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SEC39	Q12745	709 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	FOB1	O13329	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	TUP1	P16649	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	MGM1	P32266	881 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	ORC2	P32833	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	STE5	P32917	917 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	REC104	P33323	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SPL2	P38839	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	TOK1	P40310	691 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	BTN2	P53286	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	SIL1	Q08199	421 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	PLP2	Q12017	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TVP38	YKR088C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	GAL11	P19659	1081 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RIT1	P23796	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	HEL1	P36113	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	DOT5	P40553	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	TAD1	P53065	400 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RET3	P53600	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	URH1	Q04179	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	OPY2	Q06810	360 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SPO75	Q07798	868 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YLR415C	O13578	112 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	NUC1	P08466	329 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
TVP38	YKR088C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	ARG1	P22768	420 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	MLH2	Q07980	695 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	TAF3	Q12297	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RAD61	Q99359	647 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RPN13	O13563	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	CIT1	P00890	479 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RAD3	P06839	778 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	ERG11	P10614	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	OM45	P16547	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	RPC53	P25441	422 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SAK1	P38990	1142 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YNL320W	P42840	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	NNF1	P47149	201 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	ADA2	Q02336	434 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	YML119W	Q03208	357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	ECI1	Q05871	280 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TVP38	YKR088C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.4 ms