RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	RSF1	Q05043	376 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRA2	YKL214C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRA2	YKL214C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
YRA2	YKL214C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YRA2	YKL214C	HUA2	Q12134	243 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRA2	YKL214C	YBT1	P32386	1661 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRA2	YKL214C	BNR1	P40450	1375 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YRA2	YKL214C	YLR358C	O13565	187 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	CYC7	P00045	113 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MTF2	P10849	440 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MIH1	P23748	554 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	CLB4	P24871	460 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
YRA2	YKL214C	PEP3	P27801	918 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	KIP1	P28742	1111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	GCS1	P35197	352 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YKL077W	P36081	392 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	UIP5	P36137	443 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PIK1	P39104	1066 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PUG1	P40100	303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	DAM1	P53267	343 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	FDC1	Q03034	503 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MDM36	Q06820	579 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	NSI1	Q12457	570 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SKM1	Q12469	655 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SEC39	Q12745	709 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ATP12	P22135	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PRE8	P23639	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SEC65	P29478	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PUP2	P32379	260 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MRP4	P32902	394 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	REC104	P33323	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	OAF3	P36023	863 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	MRPL36	P36531	177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	FAT1	P38225	669 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ATG14	P38270	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SSU1	P41930	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	HNT2	P49775	206 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	HFM1	P51979	1187 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	BSC5	P53755	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	VHS3	Q08438	674 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	HFI1	Q12060	488 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PCD1	Q12524	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	DNF3	Q12674	1656 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PHO5	P00635	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	TPK1	P06244	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PUT4	P15380	627 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ERS1	P17261	260 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ADK2	P26364	225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	GYP6	P32806	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YUH1	P35127	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	STB6	P36085	766 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	YAP3	P38749	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	PEX18	P38855	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	EAF5	P39995	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	SPO22	P40511	975 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	STU2	P46675	888 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	GYP7	P48365	746 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	RAD17	P48581	401 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	NIT3	P49954	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	NNF2	P53253	936 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	LSB1	P53281	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	INP2	Q03824	705 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YRA2	YKL214C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
YRA2	YKL214C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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