RNA–Protein interactions for RNA: YHR107C

CDC12, Transcript of Component of the septin ring that is required for cytokinesis, yeast

Gene CDC12, Length 1,224 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CDC12	YHR107C	DRE2	P36152	348 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	TVP38	P36164	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	APN2	P38207	520 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MSS4	P38994	779 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	YEN1	P40028	759 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	OPT1	P40897	799 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	RET2	P43621	546 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	CTR1	P49573	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	PNG1	Q02890	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	NRG1	Q03125	231 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	AIM39	Q08223	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MET3	P08536	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MAK31	P23059	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	PPZ1	P26570	692 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	ECM1	P39715	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	YJR096W	P47137	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	YGR153W	P48238	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MDR1	P53258	950 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	DLT1	Q04216	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MYO1	P08964	1928 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	KIN82	P25341	720 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
CDC12	YHR107C	SIC1	P38634	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	BUD16	P39988	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	AMA1	P50082	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	ESC8	Q08119	714 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MIH1	P23748	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	CTS1	P29029	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	BUD2	P33314	1104 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	SLX1	P38324	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
CDC12	YHR107C	CSM2	P40465	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	REC102	Q02721	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	GAD1	Q04792	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	PIG1	Q06216	648 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	DSE3	Q08729	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	NUM1	Q00402	2748 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MBR1	P23493	339 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MRC1	P25588	1096 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MNN4	P36044	1178 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	KTR4	P38131	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	STB5	P38699	743 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MUK1	Q02866	612 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	MCM21	Q06675	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	IRC10	Q08118	586 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	TRE2	Q08693	809 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	ARP6	Q12509	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	FAB1	P34756	2278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDC12	YHR107C	CDC16	P09798	840 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	BET2	P20133	325 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	ADK2	P26364	225 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	IMP2'	P32351	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	TRM2	P33753	639 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	MRPL7	P36519	292 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	SUL1	P38359	859 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	FKH2	P41813	862 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	SAD1	P43589	448 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	ASE1	P50275	885 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	ALT2	P52892	507 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	TFC6	Q06339	672 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	CRD1	Q07560	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	RIM20	Q12033	661 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	NTO1	Q12311	748 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	MOT1	P32333	1867 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CDC12	YHR107C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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