RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RMR1	P53060	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	GPG1	P53130	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	APP1	P53933	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	IRC4	Q03036	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SRC1	Q03707	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MMR1	Q06324	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SNA4	Q07549	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SGO1	Q08490	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	DAS2	Q12084	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	UTR1	P21373	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SUR1	P33300	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	TPO5	P36029	618 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SUR2	P38992	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	BRE2	P43132	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	LOH1	P47055	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	NPY1	P53164	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MNT4	P53745	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	HDA1	P53973	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MEC3	Q02574	474 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	UME1	Q03010	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SPP1	Q03012	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	URC2	Q04411	772 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	GIM5	Q04493	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MRX10	Q05648	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SOG2	Q08817	791 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	FLC1	Q08967	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	GIS3	Q12418	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RAD61	Q99359	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YAK1	P14680	807 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	BAS1	P22035	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	AFG2	P32794	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	GYP6	P32806	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	BEM3	P32873	1128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	OCT1	P35999	772 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	LIF1	P53150	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	CBK1	P53894	756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ARP4	P80428	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SLT2	Q00772	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	TBF1	Q02457	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ECM23	Q02710	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ECM18	Q04623	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
MSC7	YHR039C	MET7	Q08645	548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	TRE2	Q08693	809 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	DDC1	Q08949	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	WHI2	P12611	486 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	AAC3	P18238	307 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	AFT1	P22149	690 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	PTP1	P25044	335 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RER1	P25560	188 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	CWH43	P25618	953 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	SIN4	P32259	974 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	LRG1	P35688	1017 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	FZO1	P38297	855 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RFC3	P38629	340 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YHR182W	P38870	785 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ACA1	P39970	489 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	CIR1	P42940	261 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	ROM1	P53046	1155 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	TIM10	P87108	93 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	UGO1	Q03327	502 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MCM21	Q06675	368 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	THI73	Q07904	523 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSC7	YHR039C	MSH5	Q12175	901 aa		4.9	□□□□□ -1.62

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