RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W NTE1Q04958 1679 aa15.9■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W POL1P13382 1468 aa15.9■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W DRS2P39524 1355 aa15.89■□□□□ 0.13
YLR349WYLR349W SPP41P38904 1435 aa15.85■□□□□ 0.13
YLR349WYLR349W SMC4Q12267 1418 aa15.82■□□□□ 0.12
YLR349WYLR349W YOR1P53049 1477 aa15.82■□□□□ 0.12
YLR349WYLR349W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
YLR349WYLR349W STU1P38198 1513 aa15.79■□□□□ 0.12
YLR349WYLR349W DNF2Q12675 1612 aa15.77■□□□□ 0.12
YLR349WYLR349W VTH1P40438 1549 aa15.76■□□□□ 0.11
YLR349WYLR349W VTH2P40890 1549 aa15.76■□□□□ 0.11
YLR349WYLR349W TSC11P40061 1430 aa15.74■□□□□ 0.11
YLR349WYLR349W NUP170P38181 1502 aa15.61■□□□□ 0.09
YLR349WYLR349W SPO14P36126 1683 aa15.57■□□□□ 0.08
YLR349WYLR349W MYO4P32492 1471 aa15.56■□□□□ 0.08
YLR349WYLR349W DOP1Q03921 1698 aa15.52■□□□□ 0.08
YLR349WYLR349W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
YLR349WYLR349W ULS1Q08562 1619 aa15.51■□□□□ 0.07
YLR349WYLR349W SNT2P53127 1403 aa15.51■□□□□ 0.07
YLR349WYLR349W YOR093CQ12275 1648 aa15.43■□□□□ 0.06
YLR349WYLR349W MET10P39692 1035 aa15.36■□□□□ 0.05
YLR349WYLR349W PDR12Q02785 1511 aa15.31■□□□□ 0.04
YLR349WYLR349W PDR10P51533 1564 aa15.26■□□□□ 0.03
YLR349WYLR349W GDB1Q06625 1536 aa15.26■□□□□ 0.03
YLR349WYLR349W IQG1Q12280 1495 aa15.25■□□□□ 0.03
YLR349WYLR349W TRM3Q07527 1436 aa15.24■□□□□ 0.03
YLR349WYLR349W STH1P32597 1359 aa15.24■□□□□ 0.03
YLR349WYLR349W MLP2P40457 1679 aa15.22■□□□□ 0.03
YLR349WYLR349W RTT106P40161 455 aa15.21■□□□□ 0.03
YLR349WYLR349W YTA7P40340 1379 aa15.21■□□□□ 0.02
YLR349WYLR349W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
YLR349WYLR349W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
YLR349WYLR349W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
YLR349WYLR349W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
YLR349WYLR349W BUD3P25558 1636 aa15.08■□□□□ 0
YLR349WYLR349W DNF3Q12674 1656 aa15.06■□□□□ 0
YLR349WYLR349W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
YLR349WYLR349W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
YLR349WYLR349W USO1P25386 1790 aa14.77□□□□□ -0.05
YLR349WYLR349W TY3B-GQ99315 1547 aa14.76□□□□□ -0.05
YLR349WYLR349W YAP3P38749 330 aa14.75□□□□□ -0.05
YLR349WYLR349W YBT1P32386 1661 aa14.74□□□□□ -0.05
YLR349WYLR349W IFH1P39520 1085 aa14.72□□□□□ -0.05
YLR349WYLR349W MAK10Q02197 733 aa14.69□□□□□ -0.06
YLR349WYLR349W YSP2Q06681 1438 aa14.68□□□□□ -0.06
YLR349WYLR349W CAT8P39113 1433 aa14.66□□□□□ -0.06
YLR349WYLR349W BNR1P40450 1375 aa14.64□□□□□ -0.07
YLR349WYLR349W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
YLR349WYLR349W CKB1P43639 278 aa14.6□□□□□ -0.07
YLR349WYLR349W TAF7Q05021 590 aa14.56□□□□□ -0.08
YLR349WYLR349W IML1P47170 1584 aa14.47□□□□□ -0.09
YLR349WYLR349W URN1Q06525 465 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
YLR349WYLR349W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
YLR349WYLR349W THI12P42883 340 aa14.41□□□□□ -0.1
YLR349WYLR349W THI5P43534 340 aa14.41□□□□□ -0.1
YLR349WYLR349W THI11P47183 340 aa14.41□□□□□ -0.1
YLR349WYLR349W THI13Q07748 340 aa14.41□□□□□ -0.1
YLR349WYLR349W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
YLR349WYLR349W IPL1P38991 367 aa14.3□□□□□ -0.12
YLR349WYLR349W YMR196WQ04336 1088 aa14.3□□□□□ -0.12
YLR349WYLR349W VMR1P38735 1592 aa14.3□□□□□ -0.12
YLR349WYLR349W HAP1P0CE41 1502 aa14.28□□□□□ -0.12
YLR349WYLR349W TYS1P36421 394 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
YLR349WYLR349W SRB8P25648 1427 aa14.25□□□□□ -0.13
YLR349WYLR349W GLN1P32288 370 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
YLR349WYLR349W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
YLR349WYLR349W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
YLR349WYLR349W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
YLR349WYLR349W APP1P53933 587 aa14.07□□□□□ -0.16
YLR349WYLR349W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
YLR349WYLR349W KRE5P22023 1365 aa13.94□□□□□ -0.18
YLR349WYLR349W PTP3P40048 928 aa13.92□□□□□ -0.18
YLR349WYLR349W BCK1Q01389 1478 aa13.87□□□□□ -0.19
YLR349WYLR349W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
YLR349WYLR349W PDR11P40550 1411 aa13.86□□□□□ -0.19
YLR349WYLR349W RIA1P53893 1110 aa13.85□□□□□ -0.19
YLR349WYLR349W REB1P21538 810 aa13.82□□□□□ -0.2
YLR349WYLR349W PRI1P10363 409 aa13.8□□□□□ -0.2
YLR349WYLR349W GCN2P15442 1659 aa13.79□□□□□ -0.2
YLR349WYLR349W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
YLR349WYLR349W YMR074CQ04773 145 aa13.79□□□□□ -0.2
YLR349WYLR349W MRX12P47084 519 aa13.78□□□□□ -0.2
YLR349WYLR349W ENT1Q12518 454 aa13.73□□□□□ -0.21
YLR349WYLR349W NUP192P47054 1683 aa13.71□□□□□ -0.21
YLR349WYLR349W ENV9Q08651 330 aa13.69□□□□□ -0.22
YLR349WYLR349W YRF1-2P40105 1681 aa13.69□□□□□ -0.22
YLR349WYLR349W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
YLR349WYLR349W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
YLR349WYLR349W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
YLR349WYLR349W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
YLR349WYLR349W CAB1Q04430 367 aa13.6□□□□□ -0.23
YLR349WYLR349W SSM4P40318 1319 aa13.58□□□□□ -0.24
YLR349WYLR349W RAD9P14737 1309 aa13.57□□□□□ -0.24
YLR349WYLR349W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
YLR349WYLR349W RAV1P47104 1357 aa13.49□□□□□ -0.25
YLR349WYLR349W ALD4P46367 519 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
YLR349WYLR349W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
YLR349WYLR349W TY4B-HP0C2J7 1802 aa13.43□□□□□ -0.26
YLR349WYLR349W TY4B-JP47024 1803 aa13.43□□□□□ -0.26
YLR349WYLR349W URB1P34241 1764 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.1 ms