RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeastyeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3YJL059W FKH1P40466 484 aa9.79□□□□□ -0.84
YHC3YJL059W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
YHC3YJL059W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
YHC3YJL059W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
YHC3YJL059W HGH1P48362 394 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
YHC3YJL059W SET1P38827 1080 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
YHC3YJL059W YJL171CP46992 396 aa9.72□□□□□ -0.85
YHC3YJL059W YPR148CQ06523 435 aa9.72□□□□□ -0.85
YHC3YJL059W TAF2P23255 1407 aa9.71□□□□□ -0.86
YHC3YJL059W VPS70P47161 811 aa9.69□□□□□ -0.86
YHC3YJL059W MRM1P25270 412 aa9.68□□□□□ -0.86
YHC3YJL059W RAM2P29703 316 aa9.68□□□□□ -0.86
YHC3YJL059W ULI1P43604 169 aa9.68□□□□□ -0.86
YHC3YJL059W MSB4Q12317 492 aa9.68□□□□□ -0.86
YHC3YJL059W YML020WQ03722 664 aa9.67□□□□□ -0.86
YHC3YJL059W IOC2Q12072 812 aa9.67□□□□□ -0.86
YHC3YJL059W LDB19Q12502 818 aa9.66□□□□□ -0.86
YHC3YJL059W LTE1P07866 1435 aa9.65□□□□□ -0.87
YHC3YJL059W ATG2P53855 1592 aa9.63□□□□□ -0.87
YHC3YJL059W URN1Q06525 465 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
YHC3YJL059W PIB1Q06651 286 aa9.63□□□□□ -0.87
YHC3YJL059W EAP1P36041 632 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
YHC3YJL059W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
YHC3YJL059W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
YHC3YJL059W MET5P47169 1442 aa9.58□□□□□ -0.88
YHC3YJL059W BMT6Q12291 365 aa9.58□□□□□ -0.88
YHC3YJL059W DSF2P38213 736 aa9.56□□□□□ -0.88
YHC3YJL059W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.56□□□□□ -0.88not detected
YHC3YJL059W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
YHC3YJL059W NOP7P53261 605 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YHC3YJL059W KIN1P13185 1064 aa9.54□□□□□ -0.88
YHC3YJL059W SLX8P40072 274 aa9.54□□□□□ -0.88
YHC3YJL059W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
YHC3YJL059W YOL036WQ08206 761 aa9.53□□□□□ -0.88
YHC3YJL059W BNI1P41832 1953 aa9.52□□□□□ -0.89
YHC3YJL059W VPS29P38759 282 aa9.52□□□□□ -0.89
YHC3YJL059W ITT1Q04638 464 aa9.52□□□□□ -0.89
YHC3YJL059W PBS2P08018 668 aa9.51□□□□□ -0.89
YHC3YJL059W CDC25P04821 1589 aa9.5□□□□□ -0.89
YHC3YJL059W RTG3P38165 486 aa9.5□□□□□ -0.89
YHC3YJL059W DBP1P24784 617 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
YHC3YJL059W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
YHC3YJL059W SET4P42948 560 aa9.47□□□□□ -0.89
YHC3YJL059W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
YHC3YJL059W SSK2P53599 1579 aa9.46□□□□□ -0.89
YHC3YJL059W TRP5P00931 707 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W TOP1P04786 769 aa9.46□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W RTG1P32607 177 aa9.46□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W SAM3Q08986 587 aa9.46□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W DNF1P32660 1571 aa9.46□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W SSA1P10591 642 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W SEC61P32915 480 aa9.44□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W AIM7Q12156 149 aa9.44□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W MMS1Q06211 1407 aa9.44□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W GEF1P37020 779 aa9.43□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W RCR1P38212 213 aa9.43□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W NCR1Q12200 1170 aa9.42□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W STS1P38637 319 aa9.41□□□□□ -0.9
YHC3YJL059W MAM3Q12296 706 aa9.39□□□□□ -0.91
YHC3YJL059W GLC3P32775 704 aa9.37□□□□□ -0.91
YHC3YJL059W SNU71P53207 620 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
YHC3YJL059W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
YHC3YJL059W IRC20Q06554 1556 aa9.34□□□□□ -0.91
YHC3YJL059W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
YHC3YJL059W RPO31P04051 1460 aa9.34□□□□□ -0.91
YHC3YJL059W UFD4P33202 1483 aa9.34□□□□□ -0.91
YHC3YJL059W SLD2P34252 453 aa9.33□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W REF2P42073 533 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W COQ8P27697 501 aa9.31□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W BRL1P38770 471 aa9.31□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W IES2P40154 320 aa9.31□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W JIP4Q03361 876 aa9.31□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W RKR1Q04781 1562 aa9.3□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W CHD1P32657 1468 aa9.29□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W GUA1P38625 525 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W NUP42P49686 430 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W DIT2P21595 489 aa9.28□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W MET10P39692 1035 aa9.28□□□□□ -0.92
YHC3YJL059W DAN4P47179 1161 aa9.26□□□□□ -0.93
YHC3YJL059W GYP5Q12344 894 aa9.26□□□□□ -0.93
YHC3YJL059W DRS2P39524 1355 aa9.25□□□□□ -0.93
YHC3YJL059W HPC2Q01448 625 aa9.25□□□□□ -0.93
YHC3YJL059W MRX12P47084 519 aa9.23□□□□□ -0.93
YHC3YJL059W ATF2P53296 535 aa9.23□□□□□ -0.93
YHC3YJL059W HTA1P04911 132 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
YHC3YJL059W HTA2P04912 132 aa9.22□□□□□ -0.93
YHC3YJL059W BRN1P38170 754 aa9.2□□□□□ -0.94
YHC3YJL059W YDL129WQ07555 291 aa9.2□□□□□ -0.94
YHC3YJL059W COX6P00427 148 aa9.19□□□□□ -0.94
YHC3YJL059W PTC4P38089 393 aa9.18□□□□□ -0.94
YHC3YJL059W SAP30P38429 201 aa9.18□□□□□ -0.94
YHC3YJL059W PAN1P32521 1480 aa9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.7 ms