RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637475.1

CACNA1A-241, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

Gene CACNA1A, Length 1,975 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-241ENST00000637475 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CACNA1A-241ENST00000637475 ARAP1Q96P48 1450 aa28.72■■■□□ 2.19
CACNA1A-241ENST00000637475 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CACNA1A-241ENST00000637475 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CACNA1A-241ENST00000637475 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CACNA1A-241ENST00000637475 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
CACNA1A-241ENST00000637475 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.63■■■□□ 2.17
CACNA1A-241ENST00000637475 CUX1P39880 1505 aa28.6■■■□□ 2.17
CACNA1A-241ENST00000637475 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.57■■■□□ 2.16
CACNA1A-241ENST00000637475 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CACNA1A-241ENST00000637475 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CACNA1A-241ENST00000637475 MAP3K1Q13233 1512 aa28.46■■■□□ 2.15
CACNA1A-241ENST00000637475 CHD1O14646 1710 aa28.45■■■□□ 2.14
CACNA1A-241ENST00000637475 FBLN2P98095 1184 aa28.41■■■□□ 2.14
CACNA1A-241ENST00000637475 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.39■■■□□ 2.14
CACNA1A-241ENST00000637475 KIF27Q86VH2 1401 aa28.39■■■□□ 2.14
CACNA1A-241ENST00000637475 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.38■■■□□ 2.13
CACNA1A-241ENST00000637475 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.38■■■□□ 2.13
CACNA1A-241ENST00000637475 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.38■■■□□ 2.13
CACNA1A-241ENST00000637475 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CACNA1A-241ENST00000637475 WDR97A6NE52 1622 aa28.35■■■□□ 2.13
CACNA1A-241ENST00000637475 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.35■■■□□ 2.13
CACNA1A-241ENST00000637475 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.34■■■□□ 2.13
CACNA1A-241ENST00000637475 ARHGEF11O15085 1522 aa28.31■■■□□ 2.12
CACNA1A-241ENST00000637475 MAPKBP1O60336 1514 aa28.29■■■□□ 2.12
CACNA1A-241ENST00000637475 GRIN2BQ13224 1484 aa28.28■■■□□ 2.12
CACNA1A-241ENST00000637475 TIAM1Q13009 1591 aa28.24■■■□□ 2.11
CACNA1A-241ENST00000637475 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.23■■■□□ 2.11
CACNA1A-241ENST00000637475 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CACNA1A-241ENST00000637475 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.23■■■□□ 2.11
CACNA1A-241ENST00000637475 PBRM1Q86U86 1689 aa28.21■■■□□ 2.11
CACNA1A-241ENST00000637475 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
CACNA1A-241ENST00000637475 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.18■■■□□ 2.1
CACNA1A-241ENST00000637475 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.17■■■□□ 2.1
CACNA1A-241ENST00000637475 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.16■■■□□ 2.1
CACNA1A-241ENST00000637475 SYNJ2O15056 1496 aa28.15■■■□□ 2.1
CACNA1A-241ENST00000637475 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CACNA1A-241ENST00000637475 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.11■■■□□ 2.09
CACNA1A-241ENST00000637475 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.11■■■□□ 2.09
CACNA1A-241ENST00000637475 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.11■■■□□ 2.09
CACNA1A-241ENST00000637475 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.1■■■□□ 2.09
CACNA1A-241ENST00000637475 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.1■■■□□ 2.09
CACNA1A-241ENST00000637475 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.06■■■□□ 2.08
CACNA1A-241ENST00000637475 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
CACNA1A-241ENST00000637475 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.99■■■□□ 2.07
CACNA1A-241ENST00000637475 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.97■■■□□ 2.07
CACNA1A-241ENST00000637475 IGF1RP08069 1367 aa27.97■■■□□ 2.07
CACNA1A-241ENST00000637475 ADAMTS12P58397 1594 aa27.95■■■□□ 2.06
CACNA1A-241ENST00000637475 GRIN2AQ12879 1464 aa27.93■■■□□ 2.06
CACNA1A-241ENST00000637475 CCER2I3L3R5 266 aa27.91■■■□□ 2.06
CACNA1A-241ENST00000637475 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.9■■■□□ 2.06
CACNA1A-241ENST00000637475 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CACNA1A-241ENST00000637475 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CACNA1A-241ENST00000637475 CEP170Q5SW79 1584 aa27.83■■■□□ 2.05
CACNA1A-241ENST00000637475 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.83■■■□□ 2.05
CACNA1A-241ENST00000637475 KCNH8Q96L42 1107 aa27.82■■■□□ 2.04
CACNA1A-241ENST00000637475 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.82■■■□□ 2.04
CACNA1A-241ENST00000637475 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.81■■■□□ 2.04
CACNA1A-241ENST00000637475 NUP160Q12769 1436 aa27.81■■■□□ 2.04
CACNA1A-241ENST00000637475 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.74■■■□□ 2.03
CACNA1A-241ENST00000637475 ITGAEP38570 1179 aa27.73■■■□□ 2.03
CACNA1A-241ENST00000637475 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CACNA1A-241ENST00000637475 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.71■■■□□ 2.03
CACNA1A-241ENST00000637475 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CACNA1A-241ENST00000637475 FKBP8Q14318 412 aa27.69■■■□□ 2.02
CACNA1A-241ENST00000637475 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.66■■■□□ 2.02
CACNA1A-241ENST00000637475 SHROOM2Q13796 1616 aa27.65■■■□□ 2.02
CACNA1A-241ENST00000637475 NEFLP07196 543 aa27.65■■■□□ 2.02
CACNA1A-241ENST00000637475 CUL7Q14999 1698 aa27.62■■■□□ 2.01
CACNA1A-241ENST00000637475 ANP32CO43423 234 aa27.61■■■□□ 2.01
CACNA1A-241ENST00000637475 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.6■■■□□ 2.01
CACNA1A-241ENST00000637475 HFM1A2PYH4 1435 aa27.59■■■□□ 2.01
CACNA1A-241ENST00000637475 UACAQ9BZF9 1416 aa27.59■■■□□ 2.01
CACNA1A-241ENST00000637475 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.58■■■□□ 2.01
CACNA1A-241ENST00000637475 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CACNA1A-241ENST00000637475 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.55■■■□□ 2
CACNA1A-241ENST00000637475 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CACNA1A-241ENST00000637475 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.54■■■□□ 2
CACNA1A-241ENST00000637475 JPH4Q96JJ6 628 aa27.54■■■□□ 2
CACNA1A-241ENST00000637475 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CACNA1A-241ENST00000637475 FMN1Q68DA7 1419 aa27.52■■■□□ 2
CACNA1A-241ENST00000637475 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.52■■■□□ 2
CACNA1A-241ENST00000637475 BCANQ96GW7 911 aa27.5■■□□□ 1.99
CACNA1A-241ENST00000637475 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.49■■□□□ 1.99
CACNA1A-241ENST00000637475 TONSLQ96HA7 1378 aa27.49■■□□□ 1.99
CACNA1A-241ENST00000637475 SAMD9Q5K651 1589 aa27.44■■□□□ 1.98
CACNA1A-241ENST00000637475 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.42■■□□□ 1.98
CACNA1A-241ENST00000637475 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.41■■□□□ 1.98
CACNA1A-241ENST00000637475 NAIPQ13075 1403 aa27.4■■□□□ 1.98
CACNA1A-241ENST00000637475 PTPRKQ15262 1439 aa27.38■■□□□ 1.97
CACNA1A-241ENST00000637475 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.38■■□□□ 1.97
CACNA1A-241ENST00000637475 NCOA2Q15596 1464 aa27.37■■□□□ 1.97
CACNA1A-241ENST00000637475 HECW1Q76N89 1606 aa27.36■■□□□ 1.97
CACNA1A-241ENST00000637475 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.36■■□□□ 1.97
CACNA1A-241ENST00000637475 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.36■■□□□ 1.97
CACNA1A-241ENST00000637475 TRIM52Q96A61 297 aa27.36■■□□□ 1.97
CACNA1A-241ENST00000637475 AKNAQ7Z591 1439 aa27.36■■□□□ 1.97
CACNA1A-241ENST00000637475 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.35■■□□□ 1.97
CACNA1A-241ENST00000637475 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CACNA1A-241ENST00000637475 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms