RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625713.2

ARRDC3-AS1-201, ARRDC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ARRDC3-AS1, Length 2,500 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18■□□□□ 0.47
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ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 WDR97A6NE52 1622 aa17.98■□□□□ 0.47
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.98■□□□□ 0.47
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ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 KCNH8Q96L42 1107 aa17.95■□□□□ 0.46
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ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.75■□□□□ 0.43
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ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.69■□□□□ 0.42
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ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.67■□□□□ 0.42
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ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa17.55■□□□□ 0.4
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ARHGEF11O15085 1522 aa17.53■□□□□ 0.4
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ERICH6BQ5W0A0 696 aa17.53■□□□□ 0.4
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.52■□□□□ 0.4
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ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.41■□□□□ 0.38
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ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PPP4R2Q9NY27 417 aa17.4■□□□□ 0.38
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NESP48681 1621 aa17.39■□□□□ 0.37
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ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.39■□□□□ 0.37
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NCOA1Q15788 1441 aa17.39■□□□□ 0.37
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.38■□□□□ 0.37
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CCDC7Q96M83 1385 aa17.36■□□□□ 0.37
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 KDM6BO15054 1643 aa17.35■□□□□ 0.37
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 MPHOSPH9Q99550 1183 aa17.35■□□□□ 0.37
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 L3MBTL2Q969R5 705 aa17.32■□□□□ 0.36
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.32■□□□□ 0.36
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CHIC2Q9UKJ5 165 aa17.32■□□□□ 0.36
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ROCK1Q13464 1354 aa17.3■□□□□ 0.36
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