RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588278.1

TPGS1-202, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Gene TPGS1, Length 2,873 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-202ENST00000588278 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TPGS1-202ENST00000588278 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TPGS1-202ENST00000588278 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.32■■□□□ 1.16
TPGS1-202ENST00000588278 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.29■■□□□ 1.16
TPGS1-202ENST00000588278 PRDM2Q13029 1718 aa22.29■■□□□ 1.16
TPGS1-202ENST00000588278 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TPGS1-202ENST00000588278 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.23■■□□□ 1.15
TPGS1-202ENST00000588278 NESP48681 1621 aa22.22■■□□□ 1.15
TPGS1-202ENST00000588278 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.21■■□□□ 1.15
TPGS1-202ENST00000588278 TRIM52Q96A61 297 aa22.17■■□□□ 1.14
TPGS1-202ENST00000588278 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TPGS1-202ENST00000588278 MSH5O43196 834 aa22.15■■□□□ 1.14
TPGS1-202ENST00000588278 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TPGS1-202ENST00000588278 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.14■■□□□ 1.13
TPGS1-202ENST00000588278 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.14■■□□□ 1.13
TPGS1-202ENST00000588278 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.12■■□□□ 1.13
TPGS1-202ENST00000588278 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TPGS1-202ENST00000588278 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.1■■□□□ 1.13
TPGS1-202ENST00000588278 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
TPGS1-202ENST00000588278 NEFLP07196 543 aa22.06■■□□□ 1.12
TPGS1-202ENST00000588278 ARID3CA6NKF2 412 aa22.03■■□□□ 1.12
TPGS1-202ENST00000588278 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TPGS1-202ENST00000588278 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.02■■□□□ 1.12
TPGS1-202ENST00000588278 TIAM1Q13009 1591 aa22.01■■□□□ 1.11
TPGS1-202ENST00000588278 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TPGS1-202ENST00000588278 TOPBP1Q92547 1522 aa21.99■■□□□ 1.11
TPGS1-202ENST00000588278 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.99■■□□□ 1.11
TPGS1-202ENST00000588278 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.97■■□□□ 1.11
TPGS1-202ENST00000588278 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TPGS1-202ENST00000588278 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.92■■□□□ 1.1
TPGS1-202ENST00000588278 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.9■■□□□ 1.1
TPGS1-202ENST00000588278 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.89■■□□□ 1.1
TPGS1-202ENST00000588278 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.89■■□□□ 1.09
TPGS1-202ENST00000588278 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.88■■□□□ 1.09
TPGS1-202ENST00000588278 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TPGS1-202ENST00000588278 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.85■■□□□ 1.09
TPGS1-202ENST00000588278 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.84■■□□□ 1.09
TPGS1-202ENST00000588278 MAPKBP1O60336 1514 aa21.83■■□□□ 1.09
TPGS1-202ENST00000588278 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TPGS1-202ENST00000588278 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TPGS1-202ENST00000588278 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.78■■□□□ 1.08
TPGS1-202ENST00000588278 MAP3K1Q13233 1512 aa21.78■■□□□ 1.08
TPGS1-202ENST00000588278 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.77■■□□□ 1.08
TPGS1-202ENST00000588278 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.77■■□□□ 1.08
TPGS1-202ENST00000588278 WDR97A6NE52 1622 aa21.76■■□□□ 1.07
TPGS1-202ENST00000588278 FMN1Q68DA7 1419 aa21.76■■□□□ 1.07
TPGS1-202ENST00000588278 ANP32CO43423 234 aa21.75■■□□□ 1.07
TPGS1-202ENST00000588278 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.75■■□□□ 1.07
TPGS1-202ENST00000588278 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.73■■□□□ 1.07
TPGS1-202ENST00000588278 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TPGS1-202ENST00000588278 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.7■■□□□ 1.07
TPGS1-202ENST00000588278 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TPGS1-202ENST00000588278 TONSLQ96HA7 1378 aa21.69■■□□□ 1.06
TPGS1-202ENST00000588278 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
TPGS1-202ENST00000588278 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.68■■□□□ 1.06
TPGS1-202ENST00000588278 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
TPGS1-202ENST00000588278 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.67■■□□□ 1.06
TPGS1-202ENST00000588278 NBR1Q14596 966 aa21.67■■□□□ 1.06
TPGS1-202ENST00000588278 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.67■■□□□ 1.06
TPGS1-202ENST00000588278 PTPRKQ15262 1439 aa21.66■■□□□ 1.06
TPGS1-202ENST00000588278 CUL7Q14999 1698 aa21.65■■□□□ 1.06
TPGS1-202ENST00000588278 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-202ENST00000588278 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-202ENST00000588278 NCOA2Q15596 1464 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-202ENST00000588278 CCER2I3L3R5 266 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-202ENST00000588278 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-202ENST00000588278 FOXD1Q16676 465 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-202ENST00000588278 FBLN2P98095 1184 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-202ENST00000588278 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.57■■□□□ 1.04
TPGS1-202ENST00000588278 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-202ENST00000588278 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-202ENST00000588278 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-202ENST00000588278 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.5■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 NAIPQ13075 1403 aa21.5■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 GRIN2BQ13224 1484 aa21.49■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.49■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 HFM1A2PYH4 1435 aa21.49■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 UACAQ9BZF9 1416 aa21.47■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TPGS1-202ENST00000588278 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.45■■□□□ 1.02
TPGS1-202ENST00000588278 CCDC184Q52MB2 194 aa21.45■■□□□ 1.02
TPGS1-202ENST00000588278 SAMD9Q5K651 1589 aa21.44■■□□□ 1.02
TPGS1-202ENST00000588278 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.44■■□□□ 1.02
TPGS1-202ENST00000588278 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TPGS1-202ENST00000588278 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.42■■□□□ 1.02
TPGS1-202ENST00000588278 ERCC6Q03468 1493 aa21.4■■□□□ 1.02
TPGS1-202ENST00000588278 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.4■■□□□ 1.02
TPGS1-202ENST00000588278 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
TPGS1-202ENST00000588278 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.39■■□□□ 1.02
TPGS1-202ENST00000588278 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.39■■□□□ 1.02
TPGS1-202ENST00000588278 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TPGS1-202ENST00000588278 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TPGS1-202ENST00000588278 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.38■■□□□ 1.01
TPGS1-202ENST00000588278 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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