RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 IFT140Q96RY7 1462 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-210ENST00000568468 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS3-210ENST00000568468 TOP2BQ02880 1626 aa10.16□□□□□ -0.78
GINS3-210ENST00000568468 POTEHQ6S545 545 aa10.16□□□□□ -0.78
GINS3-210ENST00000568468 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.16□□□□□ -0.78
GINS3-210ENST00000568468 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
GINS3-210ENST00000568468 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
GINS3-210ENST00000568468 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.15□□□□□ -0.79
GINS3-210ENST00000568468 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GINS3-210ENST00000568468 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-210ENST00000568468 SOGA1O94964 1423 aa10.13□□□□□ -0.79
GINS3-210ENST00000568468 POLA2Q14181 598 aa10.12□□□□□ -0.79
GINS3-210ENST00000568468 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
GINS3-210ENST00000568468 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.09□□□□□ -0.79
GINS3-210ENST00000568468 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.08□□□□□ -0.8
GINS3-210ENST00000568468 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
GINS3-210ENST00000568468 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.07□□□□□ -0.8
GINS3-210ENST00000568468 WDR97A6NE52 1622 aa10.07□□□□□ -0.8
GINS3-210ENST00000568468 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
GINS3-210ENST00000568468 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
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GINS3-210ENST00000568468 GRIN2BQ13224 1484 aa10.02□□□□□ -0.81
GINS3-210ENST00000568468 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.02□□□□□ -0.81
GINS3-210ENST00000568468 KIF27Q86VH2 1401 aa10□□□□□ -0.81
GINS3-210ENST00000568468 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10□□□□□ -0.81
GINS3-210ENST00000568468 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GINS3-210ENST00000568468 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.98□□□□□ -0.81
GINS3-210ENST00000568468 OSCARQ8IYS5 282 aa9.97□□□□□ -0.81
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GINS3-210ENST00000568468 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.94□□□□□ -0.82
GINS3-210ENST00000568468 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
GINS3-210ENST00000568468 CHD1O14646 1710 aa9.93□□□□□ -0.82
GINS3-210ENST00000568468 ADAMTS12P58397 1594 aa9.92□□□□□ -0.82
GINS3-210ENST00000568468 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GINS3-210ENST00000568468 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.91□□□□□ -0.82
GINS3-210ENST00000568468 FBLN2P98095 1184 aa9.91□□□□□ -0.82
GINS3-210ENST00000568468 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GINS3-210ENST00000568468 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.9□□□□□ -0.82
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GINS3-210ENST00000568468 NUP160Q12769 1436 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-210ENST00000568468 GOLGA3Q08378 1498 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-210ENST00000568468 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS3-210ENST00000568468 KIF21BO75037 1637 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-210ENST00000568468 CEP170Q5SW79 1584 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-210ENST00000568468 ARHGEF11O15085 1522 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-210ENST00000568468 CUL7Q14999 1698 aa9.83□□□□□ -0.84
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GINS3-210ENST00000568468 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.82□□□□□ -0.84
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GINS3-210ENST00000568468 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS3-210ENST00000568468 CEP162Q5TB80 1403 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS3-210ENST00000568468 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS3-210ENST00000568468 P3H3Q8IVL6 736 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS3-210ENST00000568468 JPH4Q96JJ6 628 aa9.73□□□□□ -0.85
GINS3-210ENST00000568468 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS3-210ENST00000568468 AKT1S1Q96B36 256 aa9.72□□□□□ -0.85
GINS3-210ENST00000568468 CLIP1P30622 1438 aa9.71□□□□□ -0.86
GINS3-210ENST00000568468 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
GINS3-210ENST00000568468 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-210ENST00000568468 SPDYE6P0CI01 402 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-210ENST00000568468 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-210ENST00000568468 IQGAP2Q13576 1575 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-210ENST00000568468 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
GINS3-210ENST00000568468 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.69□□□□□ -0.86
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GINS3-210ENST00000568468 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.66□□□□□ -0.86
GINS3-210ENST00000568468 DISP1Q96F81 1524 aa9.64□□□□□ -0.87
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GINS3-210ENST00000568468 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.62□□□□□ -0.87
GINS3-210ENST00000568468 SAMD9Q5K651 1589 aa9.61□□□□□ -0.87
GINS3-210ENST00000568468 KIAA0556O60303 1618 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS3-210ENST00000568468 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
GINS3-210ENST00000568468 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
GINS3-210ENST00000568468 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS3-210ENST00000568468 PTPRGP23470 1445 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS3-210ENST00000568468 ARID3CA6NKF2 412 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS3-210ENST00000568468 PROM2Q8N271 834 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS3-210ENST00000568468 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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GINS3-210ENST00000568468 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GINS3-210ENST00000568468 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-210ENST00000568468 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-210ENST00000568468 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-210ENST00000568468 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GINS3-210ENST00000568468 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.54□□□□□ -0.88
GINS3-210ENST00000568468 FMN1Q68DA7 1419 aa9.54□□□□□ -0.88
GINS3-210ENST00000568468 UACAQ9BZF9 1416 aa9.54□□□□□ -0.88
GINS3-210ENST00000568468 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-210ENST00000568468 ABCC2Q92887 1545 aa9.53□□□□□ -0.88
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