RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566286.5

TCF4-232, Transcript of transcription factor 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TCF4, Length 2,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4-232ENST00000566286 CLIP1P30622 1438 aa16.21■□□□□ 0.19
TCF4-232ENST00000566286 PRDM2Q13029 1718 aa16.21■□□□□ 0.19
TCF4-232ENST00000566286 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.21■□□□□ 0.19
TCF4-232ENST00000566286 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.2■□□□□ 0.18
TCF4-232ENST00000566286 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TCF4-232ENST00000566286 MIER1Q8N108 512 aa16.15■□□□□ 0.18
TCF4-232ENST00000566286 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TCF4-232ENST00000566286 FBLN2P98095 1184 aa16.13■□□□□ 0.17
TCF4-232ENST00000566286 APLP2Q06481 763 aa16.13■□□□□ 0.17
TCF4-232ENST00000566286 CUX1P39880 1505 aa16.13■□□□□ 0.17
TCF4-232ENST00000566286 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.12■□□□□ 0.17
TCF4-232ENST00000566286 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.1■□□□□ 0.17
TCF4-232ENST00000566286 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.06■□□□□ 0.16
TCF4-232ENST00000566286 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.04■□□□□ 0.16
TCF4-232ENST00000566286 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.03■□□□□ 0.16
TCF4-232ENST00000566286 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16■□□□□ 0.15
TCF4-232ENST00000566286 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TCF4-232ENST00000566286 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TCF4-232ENST00000566286 TMEM132AQ24JP5 1023 aa15.97■□□□□ 0.15
TCF4-232ENST00000566286 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.96■□□□□ 0.15
TCF4-232ENST00000566286 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
TCF4-232ENST00000566286 NESP48681 1621 aa15.95■□□□□ 0.14
TCF4-232ENST00000566286 KIF27Q86VH2 1401 aa15.92■□□□□ 0.14
TCF4-232ENST00000566286 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.92■□□□□ 0.14
TCF4-232ENST00000566286 PRXQ9BXM0 1461 aa15.91■□□□□ 0.14
TCF4-232ENST00000566286 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.91■□□□□ 0.14
TCF4-232ENST00000566286 ARAP1Q96P48 1450 aa15.9■□□□□ 0.14
TCF4-232ENST00000566286 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.9■□□□□ 0.14
TCF4-232ENST00000566286 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TCF4-232ENST00000566286 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.87■□□□□ 0.13
TCF4-232ENST00000566286 CUX2O14529 1486 aa15.87■□□□□ 0.13
TCF4-232ENST00000566286 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.86■□□□□ 0.13
TCF4-232ENST00000566286 C14orf37Q86TY3 774 aa15.85■□□□□ 0.13
TCF4-232ENST00000566286 TOPBP1Q92547 1522 aa15.83■□□□□ 0.12
TCF4-232ENST00000566286 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
TCF4-232ENST00000566286 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
TCF4-232ENST00000566286 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
TCF4-232ENST00000566286 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
TCF4-232ENST00000566286 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.77■□□□□ 0.12
TCF4-232ENST00000566286 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.77■□□□□ 0.12
TCF4-232ENST00000566286 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
TCF4-232ENST00000566286 IGF1RP08069 1367 aa15.77■□□□□ 0.11
TCF4-232ENST00000566286 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.76■□□□□ 0.11
TCF4-232ENST00000566286 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.75■□□□□ 0.11
TCF4-232ENST00000566286 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.75■□□□□ 0.11
TCF4-232ENST00000566286 SLC4A2P04920 1241 aa15.74■□□□□ 0.11
TCF4-232ENST00000566286 CFAP44Q96MT7 982 aa15.74■□□□□ 0.11
TCF4-232ENST00000566286 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TCF4-232ENST00000566286 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.71■□□□□ 0.11
TCF4-232ENST00000566286 WDR97A6NE52 1622 aa15.7■□□□□ 0.1
TCF4-232ENST00000566286 MAP3K1Q13233 1512 aa15.7■□□□□ 0.1
TCF4-232ENST00000566286 PKD2Q13563 968 aa15.69■□□□□ 0.1
TCF4-232ENST00000566286 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.68■□□□□ 0.1
TCF4-232ENST00000566286 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
TCF4-232ENST00000566286 MAPKBP1O60336 1514 aa15.65■□□□□ 0.1
TCF4-232ENST00000566286 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.65■□□□□ 0.1
TCF4-232ENST00000566286 TIAM1Q13009 1591 aa15.64■□□□□ 0.1
TCF4-232ENST00000566286 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.64■□□□□ 0.09
TCF4-232ENST00000566286 NBR1Q14596 966 aa15.63■□□□□ 0.09
TCF4-232ENST00000566286 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.62■□□□□ 0.09
TCF4-232ENST00000566286 CUL7Q14999 1698 aa15.62■□□□□ 0.09
TCF4-232ENST00000566286 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TCF4-232ENST00000566286 FBXO3Q9UK99 471 aa15.61■□□□□ 0.09
TCF4-232ENST00000566286 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.6■□□□□ 0.09
TCF4-232ENST00000566286 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
TCF4-232ENST00000566286 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
TCF4-232ENST00000566286 ITGAEP38570 1179 aa15.58■□□□□ 0.08
TCF4-232ENST00000566286 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.58■□□□□ 0.08
TCF4-232ENST00000566286 KLHL34Q8N239 644 aa15.57■□□□□ 0.08
TCF4-232ENST00000566286 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.56■□□□□ 0.08
TCF4-232ENST00000566286 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TCF4-232ENST00000566286 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.54■□□□□ 0.08
TCF4-232ENST00000566286 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.54■□□□□ 0.08
TCF4-232ENST00000566286 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.53■□□□□ 0.08
TCF4-232ENST00000566286 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.53■□□□□ 0.08
TCF4-232ENST00000566286 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
TCF4-232ENST00000566286 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.51■□□□□ 0.07
TCF4-232ENST00000566286 KCNH8Q96L42 1107 aa15.5■□□□□ 0.07
TCF4-232ENST00000566286 WDR62O43379 1518 aa15.5■□□□□ 0.07
TCF4-232ENST00000566286 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TCF4-232ENST00000566286 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.49■□□□□ 0.07
TCF4-232ENST00000566286 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TCF4-232ENST00000566286 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TCF4-232ENST00000566286 PBRM1Q86U86 1689 aa15.47■□□□□ 0.07
TCF4-232ENST00000566286 CCER2I3L3R5 266 aa15.47■□□□□ 0.07
TCF4-232ENST00000566286 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TCF4-232ENST00000566286 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 NEFLP07196 543 aa15.45■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.44■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.43■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 IFT140Q96RY7 1462 aa15.42■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 ERCC6Q03468 1493 aa15.41■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.41■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 ANP32CO43423 234 aa15.41■□□□□ 0.06
TCF4-232ENST00000566286 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms