RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560676.5

AKAP13-222, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene AKAP13, Length 3,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-222	ENST00000560676	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		12.17	□□□□□ -0.46
AKAP13-222	ENST00000560676	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		12.16	□□□□□ -0.46
AKAP13-222	ENST00000560676	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		12.15	□□□□□ -0.46
AKAP13-222	ENST00000560676	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	KCNH8	Q96L42	1107 aa		12.13	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	PRDM2	Q13029	1718 aa		12.11	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	WDR97	A6NE52	1622 aa		12.11	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		12.11	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		12.11	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		12.1	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	12.1	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		12.09	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	CCER2	I3L3R5	266 aa		12.08	□□□□□ -0.47
AKAP13-222	ENST00000560676	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	FKBP8	Q14318	412 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	ANP32C	O43423	234 aa		12.06	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	NEFL	P07196	543 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		12.05	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	P3H3	Q8IVL6	736 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		12.04	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	BCAN	Q96GW7	911 aa		12.03	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		12.02	□□□□□ -0.48
AKAP13-222	ENST00000560676	TONSL	Q96HA7	1378 aa		12.01	□□□□□ -0.49
AKAP13-222	ENST00000560676	FMN1	Q68DA7	1419 aa		11.99	□□□□□ -0.49
AKAP13-222	ENST00000560676	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.99	□□□□□ -0.49
AKAP13-222	ENST00000560676	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.98	□□□□□ -0.49
AKAP13-222	ENST00000560676	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
AKAP13-222	ENST00000560676	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		11.98	□□□□□ -0.49
AKAP13-222	ENST00000560676	UACA	Q9BZF9	1416 aa		11.97	□□□□□ -0.49
AKAP13-222	ENST00000560676	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.97	□□□□□ -0.49
AKAP13-222	ENST00000560676	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.97	□□□□□ -0.49
AKAP13-222	ENST00000560676	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		11.97	□□□□□ -0.49
AKAP13-222	ENST00000560676	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	CUL7	Q14999	1698 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	TOPBP1	Q92547	1522 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	PTPRK	Q15262	1439 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	NAIP	Q13075	1403 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP13-222	ENST00000560676	NCOA2	Q15596	1464 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP13-222	ENST00000560676	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
AKAP13-222	ENST00000560676	FBLN2	P98095	1184 aa		11.87	□□□□□ -0.51
AKAP13-222	ENST00000560676	SAMD9	Q5K651	1589 aa		11.86	□□□□□ -0.51
AKAP13-222	ENST00000560676	GRIN2B	Q13224	1484 aa		11.86	□□□□□ -0.51
AKAP13-222	ENST00000560676	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.85	□□□□□ -0.51
AKAP13-222	ENST00000560676	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		11.85	□□□□□ -0.51
AKAP13-222	ENST00000560676	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		11.84	□□□□□ -0.51
AKAP13-222	ENST00000560676	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
AKAP13-222	ENST00000560676	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		11.83	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	11.82	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		11.82	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		11.82	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	ARHGEF11	O15085	1522 aa		11.81	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	AKNA	Q7Z591	1439 aa		11.81	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	BCL11A	Q9H165	835 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		11.79	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	NES	P48681	1621 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	HECW1	Q76N89	1606 aa		11.78	□□□□□ -0.52
AKAP13-222	ENST00000560676	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	MIA2	Q96PC5	1412 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		11.75	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	NCOA1	Q15788	1441 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	MSH5	O43196	834 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	CCDC7	Q96M83	1385 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP13-222	ENST00000560676	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54

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