RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556170.5

NEK9-209, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 5

Gene NEK9, Length 3,975 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-209ENST00000556170 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.94■□□□□ 0.94
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NEK9-209ENST00000556170 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.93■□□□□ 0.94
NEK9-209ENST00000556170 CUX1P39880 1505 aa20.92■□□□□ 0.94
NEK9-209ENST00000556170 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
NEK9-209ENST00000556170 CFTRP13569 1480 aa20.92■□□□□ 0.94
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NEK9-209ENST00000556170 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.91■□□□□ 0.94
NEK9-209ENST00000556170 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.9■□□□□ 0.94
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NEK9-209ENST00000556170 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.88■□□□□ 0.93
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NEK9-209ENST00000556170 FMN1Q68DA7 1419 aa20.63■□□□□ 0.89
NEK9-209ENST00000556170 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.62■□□□□ 0.89
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NEK9-209ENST00000556170 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.61■□□□□ 0.89
NEK9-209ENST00000556170 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
NEK9-209ENST00000556170 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.6■□□□□ 0.89
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NEK9-209ENST00000556170 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.88
NEK9-209ENST00000556170 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
NEK9-209ENST00000556170 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NEK9-209ENST00000556170 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.882e-6■■□□□ 13.5
NEK9-209ENST00000556170 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NEK9-209ENST00000556170 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.54■□□□□ 0.88
NEK9-209ENST00000556170 ERCC6Q03468 1493 aa20.53■□□□□ 0.88
NEK9-209ENST00000556170 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.53■□□□□ 0.88
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NEK9-209ENST00000556170 TSPY10P0CW01 314 aa20.53■□□□□ 0.88
NEK9-209ENST00000556170 TOPBP1Q92547 1522 aa20.52■□□□□ 0.88
NEK9-209ENST00000556170 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.876e-8■■■■■ 46.1
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NEK9-209ENST00000556170 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.47■□□□□ 0.87
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NEK9-209ENST00000556170 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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NEK9-209ENST00000556170 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.28■□□□□ 0.84
NEK9-209ENST00000556170 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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NEK9-209ENST00000556170 WDR97A6NE52 1622 aa20.21■□□□□ 0.83
NEK9-209ENST00000556170 UACAQ9BZF9 1416 aa20.19■□□□□ 0.82
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NEK9-209ENST00000556170 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
NEK9-209ENST00000556170 NUP155O75694 1391 aa20.17■□□□□ 0.82
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NEK9-209ENST00000556170 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.16■□□□□ 0.82
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NEK9-209ENST00000556170 HFM1A2PYH4 1435 aa20.1■□□□□ 0.81
NEK9-209ENST00000556170 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.08■□□□□ 0.81
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NEK9-209ENST00000556170 MAP3K1Q13233 1512 aa20.08■□□□□ 0.8
NEK9-209ENST00000556170 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.07■□□□□ 0.8
NEK9-209ENST00000556170 MAPKBP1O60336 1514 aa20.07■□□□□ 0.8
NEK9-209ENST00000556170 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NEK9-209ENST00000556170 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.05■□□□□ 0.8
NEK9-209ENST00000556170 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.05■□□□□ 0.8
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