RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	PBRM1	Q86U86	1689 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FGD4-215	ENST00000551984	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FGD4-215	ENST00000551984	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FGD4-215	ENST00000551984	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FGD4-215	ENST00000551984	TOP2B	Q02880	1626 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FGD4-215	ENST00000551984	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FGD4-215	ENST00000551984	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FGD4-215	ENST00000551984	FBLN2	P98095	1184 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FGD4-215	ENST00000551984	SYNJ2	O15056	1496 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FGD4-215	ENST00000551984	SYNJ1	O43426	1573 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FGD4-215	ENST00000551984	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
FGD4-215	ENST00000551984	APLP2	Q06481	763 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FGD4-215	ENST00000551984	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FGD4-215	ENST00000551984	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
FGD4-215	ENST00000551984	ADAMTS12	P58397	1594 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FGD4-215	ENST00000551984	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FGD4-215	ENST00000551984	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FGD4-215	ENST00000551984	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FGD4-215	ENST00000551984	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FGD4-215	ENST00000551984	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FGD4-215	ENST00000551984	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FGD4-215	ENST00000551984	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FGD4-215	ENST00000551984	NUP160	Q12769	1436 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FGD4-215	ENST00000551984	CAPN15	O75808	1086 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FGD4-215	ENST00000551984	CEP170	Q5SW79	1584 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FGD4-215	ENST00000551984	DSG3	P32926	999 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FGD4-215	ENST00000551984	SHROOM2	Q13796	1616 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FGD4-215	ENST00000551984	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
FGD4-215	ENST00000551984	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		11.12	□□□□□ -0.63
FGD4-215	ENST00000551984	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
FGD4-215	ENST00000551984	CUL7	Q14999	1698 aa		11.07	□□□□□ -0.64
FGD4-215	ENST00000551984	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		11.07	□□□□□ -0.64
FGD4-215	ENST00000551984	KIF27	Q86VH2	1401 aa		11.07	□□□□□ -0.64
FGD4-215	ENST00000551984	IGF1R	P08069	1367 aa		11.06	□□□□□ -0.64
FGD4-215	ENST00000551984	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
FGD4-215	ENST00000551984	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
FGD4-215	ENST00000551984	JPH4	Q96JJ6	628 aa		11.03	□□□□□ -0.64
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		11.01	□□□□□ -0.65
FGD4-215	ENST00000551984	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		10.98	□□□□□ -0.65
FGD4-215	ENST00000551984	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.66
FGD4-215	ENST00000551984	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		10.94	□□□□□ -0.66
FGD4-215	ENST00000551984	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		10.93	□□□□□ -0.66
FGD4-215	ENST00000551984	IQGAP2	Q13576	1575 aa		10.92	□□□□□ -0.66
FGD4-215	ENST00000551984	MAPKBP1	O60336	1514 aa		10.91	□□□□□ -0.66
FGD4-215	ENST00000551984	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		10.9	□□□□□ -0.66
FGD4-215	ENST00000551984	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		10.88	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		10.87	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		10.87	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		10.87	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	PTPRG	P23470	1445 aa		10.86	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	DISP1	Q96F81	1524 aa		10.86	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	DIP2B	Q9P265	1576 aa		10.86	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	10.85	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		10.85	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	ABCB7	O75027	752 aa		10.85	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		10.83	□□□□□ -0.67
FGD4-215	ENST00000551984	PRX	Q9BXM0	1461 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA0556	O60303	1618 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FGD4-215	ENST00000551984	ABCC2	Q92887	1545 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FGD4-215	ENST00000551984	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FGD4-215	ENST00000551984	UACA	Q9BZF9	1416 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FGD4-215	ENST00000551984	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FGD4-215	ENST00000551984	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		10.77	□□□□□ -0.68
FGD4-215	ENST00000551984	GLI2	P10070	1586 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	TSPOAP1	O95153	1857 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	GOLGA3	Q08378	1498 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	ASXL2	Q76L83	1435 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	POTEH	Q6S545	545 aa		10.73	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	EEA1	Q15075	1411 aa		10.73	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	ABCA8	O94911	1581 aa		10.73	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	KDM6B	O15054	1643 aa		10.72	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		10.72	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
FGD4-215	ENST00000551984	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		10.71	□□□□□ -0.7
FGD4-215	ENST00000551984	SAMD9	Q5K651	1589 aa		10.7	□□□□□ -0.7
FGD4-215	ENST00000551984	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FGD4-215	ENST00000551984	POLA2	Q14181	598 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FGD4-215	ENST00000551984	KIF21B	O75037	1637 aa		10.66	□□□□□ -0.7
FGD4-215	ENST00000551984	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
FGD4-215	ENST00000551984	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		10.65	□□□□□ -0.71
FGD4-215	ENST00000551984	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FGD4-215	ENST00000551984	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGD4-215	ENST00000551984	ATP10B	O94823	1461 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGD4-215	ENST00000551984	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FGD4-215	ENST00000551984	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGD4-215	ENST00000551984	P3H3	Q8IVL6	736 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGD4-215	ENST00000551984	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
FGD4-215	ENST00000551984	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGD4-215	ENST00000551984	CD109	Q6YHK3	1445 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGD4-215	ENST00000551984	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		10.58	□□□□□ -0.72
FGD4-215	ENST00000551984	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		10.57	□□□□□ -0.72
FGD4-215	ENST00000551984	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
FGD4-215	ENST00000551984	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		10.57	□□□□□ -0.72

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