RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543447.5

ATE1-209, Transcript of arginyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 4,826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1-209ENST00000543447 KIF21BO75037 1637 aa22.16■■□□□ 1.14
ATE1-209ENST00000543447 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.11■■□□□ 1.13
ATE1-209ENST00000543447 FKBP8Q14318 412 aa22.11■■□□□ 1.13
ATE1-209ENST00000543447 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.1■■□□□ 1.13
ATE1-209ENST00000543447 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATE1-209ENST00000543447 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATE1-209ENST00000543447 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.07■■□□□ 1.12
ATE1-209ENST00000543447 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ATE1-209ENST00000543447 IGF1RP08069 1367 aa22.06■■□□□ 1.12
ATE1-209ENST00000543447 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
ATE1-209ENST00000543447 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.02■■□□□ 1.12
ATE1-209ENST00000543447 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.02■■□□□ 1.12
ATE1-209ENST00000543447 TOP2BQ02880 1626 aa22.01■■□□□ 1.11
ATE1-209ENST00000543447 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ATE1-209ENST00000543447 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.99■■□□□ 1.11
ATE1-209ENST00000543447 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.98■■□□□ 1.11
ATE1-209ENST00000543447 CFTRP13569 1480 aa21.98■■□□□ 1.11
ATE1-209ENST00000543447 PRXQ9BXM0 1461 aa21.97■■□□□ 1.11
ATE1-209ENST00000543447 ARAP1Q96P48 1450 aa21.97■■□□□ 1.11
ATE1-209ENST00000543447 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.96■■□□□ 1.11
ATE1-209ENST00000543447 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.96■■□□□ 1.11
ATE1-209ENST00000543447 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ATE1-209ENST00000543447 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
ATE1-209ENST00000543447 CUX1P39880 1505 aa21.93■■□□□ 1.1
ATE1-209ENST00000543447 FMN1Q68DA7 1419 aa21.93■■□□□ 1.1
ATE1-209ENST00000543447 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.92■■□□□ 1.1
ATE1-209ENST00000543447 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.92■■□□□ 1.1
ATE1-209ENST00000543447 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.9■■□□□ 1.1
ATE1-209ENST00000543447 HMGXB3Q12766 1538 aa21.89■■□□□ 1.1
ATE1-209ENST00000543447 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.86■■□□□ 1.09
ATE1-209ENST00000543447 TSPY4P0CV99 314 aa21.83■■□□□ 1.09
ATE1-209ENST00000543447 TSPY10P0CW01 314 aa21.83■■□□□ 1.09
ATE1-209ENST00000543447 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
ATE1-209ENST00000543447 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ATE1-209ENST00000543447 MRS2Q9HD23 443 aa21.81■■□□□ 1.08
ATE1-209ENST00000543447 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ATE1-209ENST00000543447 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.78■■□□□ 1.08
ATE1-209ENST00000543447 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.77■■□□□ 1.08
ATE1-209ENST00000543447 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.77■■□□□ 1.08
ATE1-209ENST00000543447 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
ATE1-209ENST00000543447 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ATE1-209ENST00000543447 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.74■■□□□ 1.07
ATE1-209ENST00000543447 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
ATE1-209ENST00000543447 FOXD1Q16676 465 aa21.72■■□□□ 1.07
ATE1-209ENST00000543447 KCNH8Q96L42 1107 aa21.69■■□□□ 1.06
ATE1-209ENST00000543447 ERCC6Q03468 1493 aa21.67■■□□□ 1.06
ATE1-209ENST00000543447 CCER2I3L3R5 266 aa21.66■■□□□ 1.06
ATE1-209ENST00000543447 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ATE1-209ENST00000543447 NESP48681 1621 aa21.65■■□□□ 1.06
ATE1-209ENST00000543447 TMC1Q8TDI8 760 aa21.65■■□□□ 1.06
ATE1-209ENST00000543447 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.64■■□□□ 1.06
ATE1-209ENST00000543447 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.64■■□□□ 1.05
ATE1-209ENST00000543447 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.61■■□□□ 1.05
ATE1-209ENST00000543447 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.6■■□□□ 1.05
ATE1-209ENST00000543447 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ATE1-209ENST00000543447 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.59■■□□□ 1.05
ATE1-209ENST00000543447 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.58■■□□□ 1.05
ATE1-209ENST00000543447 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.57■■□□□ 1.04
ATE1-209ENST00000543447 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ATE1-209ENST00000543447 TIAM1Q13009 1591 aa21.56■■□□□ 1.04
ATE1-209ENST00000543447 TOPBP1Q92547 1522 aa21.55■■□□□ 1.04
ATE1-209ENST00000543447 RGL3Q3MIN7 710 aa21.55■■□□□ 1.04
ATE1-209ENST00000543447 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.55■■□□□ 1.04
ATE1-209ENST00000543447 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.54■■□□□ 1.04
ATE1-209ENST00000543447 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ATE1-209ENST00000543447 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.53■■□□□ 1.04
ATE1-209ENST00000543447 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.51■■□□□ 1.03
ATE1-209ENST00000543447 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.49■■□□□ 1.03
ATE1-209ENST00000543447 PKD2Q13563 968 aa21.48■■□□□ 1.03
ATE1-209ENST00000543447 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
ATE1-209ENST00000543447 NCOA2Q15596 1464 aa21.44■■□□□ 1.02
ATE1-209ENST00000543447 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.44■■□□□ 1.02
ATE1-209ENST00000543447 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.44■■□□□ 1.02
ATE1-209ENST00000543447 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.44■■□□□ 1.02
ATE1-209ENST00000543447 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.43■■□□□ 1.02
ATE1-209ENST00000543447 UACAQ9BZF9 1416 aa21.42■■□□□ 1.02
ATE1-209ENST00000543447 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.41■■□□□ 1.02
ATE1-209ENST00000543447 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.4■■□□□ 1.02
ATE1-209ENST00000543447 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ATE1-209ENST00000543447 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
ATE1-209ENST00000543447 JPH4Q96JJ6 628 aa21.38■■□□□ 1.01
ATE1-209ENST00000543447 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ATE1-209ENST00000543447 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ATE1-209ENST00000543447 NUP155O75694 1391 aa21.35■■□□□ 1.01
ATE1-209ENST00000543447 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.35■■□□□ 1.01
ATE1-209ENST00000543447 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ATE1-209ENST00000543447 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.33■■□□□ 1.01
ATE1-209ENST00000543447 MAP3K1Q13233 1512 aa21.33■■□□□ 1
ATE1-209ENST00000543447 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.32■■□□□ 1
ATE1-209ENST00000543447 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
ATE1-209ENST00000543447 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.31■■□□□ 1
ATE1-209ENST00000543447 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 12e-7■■■■■ 29.2
ATE1-209ENST00000543447 WDR97A6NE52 1622 aa21.29■■□□□ 1
ATE1-209ENST00000543447 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
ATE1-209ENST00000543447 HFM1A2PYH4 1435 aa21.27■■□□□ 1
ATE1-209ENST00000543447 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.26■□□□□ 0.99
ATE1-209ENST00000543447 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
ATE1-209ENST00000543447 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
ATE1-209ENST00000543447 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
ATE1-209ENST00000543447 GRIN2BQ13224 1484 aa21.25■□□□□ 0.99
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