RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.08■□□□□ 0
CS-202ENST00000542324 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.05■□□□□ 0
CS-202ENST00000542324 WDR97A6NE52 1622 aa15.02■□□□□ -0
CS-202ENST00000542324 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.02■□□□□ -0
CS-202ENST00000542324 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
CS-202ENST00000542324 CCER2I3L3R5 266 aa15□□□□□ -0.01
CS-202ENST00000542324 IGF1RP08069 1367 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-202ENST00000542324 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-202ENST00000542324 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CS-202ENST00000542324 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-202ENST00000542324 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 26.8
CS-202ENST00000542324 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-202ENST00000542324 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-202ENST00000542324 NEFLP07196 543 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-202ENST00000542324 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-202ENST00000542324 KCNH8Q96L42 1107 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-202ENST00000542324 ITGAEP38570 1179 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-202ENST00000542324 FKBP8Q14318 412 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-202ENST00000542324 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-202ENST00000542324 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CS-202ENST00000542324 ANP32CO43423 234 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-202ENST00000542324 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-202ENST00000542324 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-202ENST00000542324 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-202ENST00000542324 CUL7Q14999 1698 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-202ENST00000542324 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-202ENST00000542324 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 BCANQ96GW7 911 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 UACAQ9BZF9 1416 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 HFM1A2PYH4 1435 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 TONSLQ96HA7 1378 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 FMN1Q68DA7 1419 aa14.77□□□□□ -0.04
CS-202ENST00000542324 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 BCL11AQ9H165 835 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 SAMD9Q5K651 1589 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 HECW1Q76N89 1606 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CS-202ENST00000542324 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 TRIM52Q96A61 297 aa14.7□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 NCOA2Q15596 1464 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 NAIPQ13075 1403 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.68□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 AKNAQ7Z591 1439 aa14.68□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.68□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.67□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 ARHGEF11O15085 1522 aa14.66□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 GRIN2BQ13224 1484 aa14.65□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 PTPRKQ15262 1439 aa14.65□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.65□□□□□ -0.06
CS-202ENST00000542324 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 TOPBP1Q92547 1522 aa14.64□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.64□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.63□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 P3H3Q8IVL6 736 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 MSH5O43196 834 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-202ENST00000542324 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-202ENST00000542324 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-202ENST00000542324 NCOA1Q15788 1441 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-202ENST00000542324 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CS-202ENST00000542324 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CS-202ENST00000542324 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-202ENST00000542324 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
CS-202ENST00000542324 MIA2Q96PC5 1412 aa14.53□□□□□ -0.08
CS-202ENST00000542324 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.51□□□□□ -0.09
CS-202ENST00000542324 CCDC7Q96M83 1385 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-202ENST00000542324 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-202ENST00000542324 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.48□□□□□ -0.09
CS-202ENST00000542324 KDM6BO15054 1643 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-202ENST00000542324 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CS-202ENST00000542324 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-202ENST00000542324 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CS-202ENST00000542324 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 NESP48681 1621 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 ROCK1Q13464 1354 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CS-202ENST00000542324 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms